Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
P18529 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
P18529 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
P18529 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P18529 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
P18529 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
P18529 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
P18529 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
P18529 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
P18529 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
P18529 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
P18529 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
P18529 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
P18529 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
P18529 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
P18529 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
P18529 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P18529 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
P18529 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
P18529 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
P18529 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
P18529 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
P18529 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
P18529 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
P18529 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P18529 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
P18529 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
P18529 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
P18529 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P18529 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P18529 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
P18529 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
P18529 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P18529 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
P18529 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P18529 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P18529 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P18529 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P18529 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
P18529 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P18529 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
P18529 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P18529 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P18529 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P18529 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P18529 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
P18529 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P18529 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P18529 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
P18529 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
P18529 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
P18529 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P18529 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P18529 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P18529 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P18529 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P18529 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P18529 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P18529 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
P18529 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P18529 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P18529 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P18529 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P18529 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P18529 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
P18529 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P18529 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
P18529 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P18529 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P18529 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
P18529 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P18529 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P18529 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
P18529 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P18529 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P18529 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P18529 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
P18529 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P18529 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P18529 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P18529 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P18529 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P18529 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P18529 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
P18529 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P18529 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
P18529 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P18529 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P18529 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P18529 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P18529 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
P18529 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P18529 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P18529 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P18529 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P18529 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P18529 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P18529 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P18529 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
P18529 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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