RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 RAB1AP62820 205 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 EFNB1P98172 346 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 HSF2Q03933 536 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 BSPH1Q075Z2 132 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 CRMP1Q14194 572 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 ETFDHQ16134 617 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 SLC35D3Q5M8T2 416 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 PRSS57Q6UWY2 283 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 MDP1Q86V88 176 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 IQCF1Q8N6M8 205 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 SLC26A10Q8NG04 563 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 PERPQ96FX8 193 aa8.59□□□□□ -1.03
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GGA3-209ENST00000580646 HRASLS5Q96KN8 279 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 GSX2Q9BZM3 304 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 SEC61A2Q9H9S3 476 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 KCNG2Q9UJ96 466 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 RABL2BQ9UNT1 228 aa8.59□□□□□ -1.03
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GGA3-209ENST00000580646 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 DSCAMO60469 2012 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 ARID1AO14497 2285 aa8.59□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 RTTNQ86VV8 2226 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 ABCA2Q9BZC7 2435 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 A0A1W2PR80 420 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 RAB36O95755 333 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 HLA-HP01893 362 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 SERPINA5P05154 406 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 COX5BP10606 129 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 PAX1P15863 534 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 SPI1P17947 270 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 CD40P25942 277 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 EPHA2P29317 976 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 CAPZA2P47755 286 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 PTH2RP49190 550 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 SLC34A1Q06495 639 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 SCRN3Q0VDG4 424 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 AQP6Q13520 282 aa8.58□□□□□ -1.04
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GGA3-209ENST00000580646 TRIP10Q15642 601 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 SNAPC1Q16533 368 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 CYB561A3Q8NBI2 242 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 NEUROG1Q92886 237 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 PTP4A1Q93096 173 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 FBXW5Q969U6 566 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 C18orf12Q96KH6 178 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 TSSK2Q96PF2 358 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 SLC29A1Q99808 456 aa8.58□□□□□ -1.04
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GGA3-209ENST00000580646 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
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GGA3-209ENST00000580646 LAMP3Q9UQV4 416 aa8.58□□□□□ -1.04
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GGA3-209ENST00000580646 SNAP29O95721 258 aa8.57□□□□□ -1.04
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GGA3-209ENST00000580646 CECR9P0C854 216 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 DANCRP0C864 163 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 CD79AP11912 226 aa8.57□□□□□ -1.04
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GGA3-209ENST00000580646 SLC2A5P22732 501 aa8.57□□□□□ -1.04
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GGA3-209ENST00000580646 ZNF83P51522 516 aa8.57□□□□□ -1.04
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GGA3-209ENST00000580646 TEX30Q5JUR7 227 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 LINC01590Q5TEZ4 76 aa8.57□□□□□ -1.04
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GGA3-209ENST00000580646 TMEM236Q5W0B7 351 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 BIVMQ86UB2 503 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 ZNF584Q8IVC4 421 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 LRRC18Q8N456 261 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 PROKR2Q8NFJ6 384 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 GJC3Q8NFK1 279 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-209ENST00000580646 KBTBD8Q8NFY9 601 aa8.57□□□□□ -1.04
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