RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489571.5

PGAP2-223, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 2

Gene PGAP2, Length 879 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-223	ENST00000489571	SPRY3	O43610	288 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	ADH4	P08319	380 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	SDHA	P31040	664 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	LIPA	P38571	399 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	ARHGDIA	P52565	204 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	MVK	Q03426	396 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	SEC23B	Q15437	767 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	HFE	Q30201	348 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	FAM107B	Q9H098	131 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	ATP8B1	O43520	1251 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	SGCE	O43556	437 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	SNX3	O60493	162 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	DOK2	O60496	412 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	GMNN	O75496	209 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	DIRAS1	O95057	198 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	ABHD16A	O95870	558 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	HTR5A	P47898	357 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	FXYD6P3	P58550	94 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	LIPN	Q5VXI9	398 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	ARL9	Q6T311	187 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	RNF148	Q8N7C7	305 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	FUZ	Q9BT04	418 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	SYT4	Q9H2B2	425 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	AURKC	Q9UQB9	309 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	UNC119B	A6NIH7	251 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	SOCS2	O14508	198 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	IMPA2	O14732	288 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	TCF21	O43680	179 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	SLC16A7	O60669	478 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	AQP6	Q13520	282 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	ADCK1	Q86TW2	530 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	RAB1C	Q92928	201 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	RAB39B	Q96DA2	213 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	TIMD4	Q96H15	378 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	POFUT1	Q9H488	388 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	MSL2	Q9HCI7	577 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571		V9GYQ6	96 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	UBOX5	O94941	541 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	MPZL1	O95297	269 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	TXNDC12	O95881	172 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	IGHV2-5	P01817	119 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	SEMG1	P04279	462 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	CD55	P08174	381 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	HSD17B1	P14061	328 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	ANPEP	P15144	967 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	ITGA2	P17301	1181 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	GSTM3	P21266	225 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	TUBG1	P23258	451 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	PSG7	Q13046	419 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	KRT72	Q14CN4	511 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	MTX3	Q5HYI7	312 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	OTP	Q5XKR4	325 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	OR52J3	Q8NH60	311 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	CCL17	Q92583	94 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	DIRC2	Q96SL1	478 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	GPA33	Q99795	319 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	RERGL	Q9H628	205 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PGAP2-223	ENST00000489571	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		13.39	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms