RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 OR5M9Q8NGP3 310 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXB3-210ENST00000489475 APH1AQ96BI3 265 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXB3-210ENST00000489475 GPR35Q9HC97 309 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
HOXB3-210ENST00000489475 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 CLPXO76031 633 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 ZFPL1O95159 310 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 C1QTNF9P0C862 333 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 OPRL1P41146 370 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 FAM180AQ6UWF9 173 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 CFAP77Q6ZQR2 320 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 OR5AK2Q8NH90 309 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 TRIB1Q96RU8 372 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 CLCF1Q9UBD9 225 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF281Q9Y2X9 895 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 ZNHIT1O43257 154 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 SOX6P35712 828 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 CEACAM16Q2WEN9 425 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 ACSM3Q53FZ2 586 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 FAM27BQ5VT28 67 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 RHOUQ7L0Q8 258 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 LINGO2Q7L985 606 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 CEACAM19Q7Z692 300 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM38BQ9NVV0 291 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 CDRT1O95170 752 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 IL1AP01583 271 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 IGHV3-9P01782 118 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 RPS19P39019 145 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF100Q8IYN0 542 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 LRRC18Q8N456 261 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 GPR137Q96N19 417 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 COMMD4Q9H0A8 199 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 GLRX2Q9NS18 164 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 SLC7A10Q9NS82 523 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM212A6NML5 194 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF878C9JN71 531 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 SC5DO75845 299 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 PAX7P23759 505 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 PLA2G5P39877 138 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 YIF1BQ5BJH7 314 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 PAMR1Q6UXH9 720 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 OR10S1Q8NGN2 331 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 OR13C5Q8NGS8 318 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 C4orf45Q96LM5 186 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 FOXB1Q99853 325 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 MED18Q9BUE0 208 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 SNTG1Q9NSN8 517 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 NCOR2Q9Y618 2525 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 OR4C45A6NMZ5 311 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 AHRRA9YTQ3 701 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 TAF4O00268 1085 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 RER1O15258 196 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 FAM87AP0C7U9 286 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 AGTR1P30556 359 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 SDC2P34741 201 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 CCR9P51686 369 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 MXD1Q05195 221 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 PRSS35Q8N3Z0 413 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF676Q8N7Q3 588 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 GJC3Q8NFK1 279 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 FBXL3Q9UKT7 428 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 R4GMQ9 66 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 TAF13Q15543 124 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 WDR38Q5JTN6 314 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 KLHL24Q6TFL4 600 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 TPK1Q9H3S4 243 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 UPB1Q9UBR1 384 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF587BE7ETH6 402 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 DVL2O14641 736 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 GATBO75879 557 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 PNPP00491 289 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 DCTDP32321 178 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 PEX19P40855 299 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 KRTCAP3Q53RY4 240 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 ZMAT1Q5H9K5 638 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 MCFD2Q8NI22 146 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 TBC1D15Q8TC07 691 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 EMC9Q9Y3B6 208 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 CASKO14936 926 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 B4GALT1P15291 398 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 CALRP27797 417 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 KIR3DL2P43630 455 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 RORCP51449 518 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 STK11Q15831 433 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF404Q494X3 552 aa23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms