RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ABCB9Q9NP78 766 aa25.31■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ST7LQ8TDW4 575 aa25.29■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PRSS35Q8N3Z0 413 aa25.26■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 APC2O95996 2303 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR5H15A6NDH6 313 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM54Q969K7 222 aa25.26■■□□□ 1.63
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 NME2P1O60361 137 aa25.25■■□□□ 1.63
CTDNEP1-210ENST00000574322 NME2P22392 152 aa25.25■■□□□ 1.63
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