RNA–Protein interactions for RNA: YOR057W

SGT1, Transcript of Cochaperone protein, yeast

Gene SGT1, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SGT1	YOR057W	PPM2	Q08282	695 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	ULS1	Q08562	1619 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	MET3	P08536	511 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	SPC29	P33419	253 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	YPT53	P36019	220 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	MRPS35	P53292	345 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	PKH1	Q03407	766 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	DLT1	Q04216	342 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	MET7	Q08645	548 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	THI21	Q08975	551 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	GDB1	Q06625	1536 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	ELO3	P40319	345 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	RSC3	Q06639	885 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	FRE5	Q08908	694 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	NGG1	P32494	702 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	SHR5	P41912	237 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	PFA3	P42836	336 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	STB4	P50104	949 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	UBA2	P52488	636 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	BNR1	P40450	1375 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	SNT2	P53127	1403 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	ERR1	P0CX10	437 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	ERR2	P0CX11	437 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	PER1	P25625	357 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	OCA5	P38738	679 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	GDH3	P39708	457 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	HXT16	P47185	567 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	MUP1	P50276	574 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	OMS1	Q06668	471 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	ACF2	Q12168	779 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SGT1	YOR057W	DIF1	O13577	133 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	YLR415C	O13578	112 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	PPS1	P38148	807 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	MUK1	Q02866	612 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	NRG1	Q03125	231 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	RPN4	Q03465	531 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	ADY4	Q05955	493 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	MCH5	Q08777	521 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	ZIP2	P53061	704 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	TMN2	Q04562	672 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	ASM4	Q05166	528 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	TIM23	P32897	222 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
SGT1	YOR057W	YBR053C	P38235	358 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	YAP3	P38749	330 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	ALY2	P47029	1046 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	AMA1	P50082	593 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	MAL11	P53048	616 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	GPR1	Q12361	961 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	BUD6	P41697	788 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	TIM44	Q01852	431 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	CRR1	Q05790	422 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	MTC2	P34246	357 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	TGL5	Q12043	749 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	TSC11	P40061	1430 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	SIC1	P38634	284 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	NUP82	P40368	713 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	YIR042C	P40586	236 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	YJL163C	P46996	555 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	DAS1	P47005	663 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SGT1	YOR057W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	MCD4	P36051	919 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	YBR259W	P38338	688 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	YHL017W	P38745	532 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	GND2	P53319	492 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	IRC13	Q08630	104 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	MDM12	Q92328	271 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	MTH1	P35198	433 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	STU2	P46675	888 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SGT1	YOR057W	VTH1	P40438	1549 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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