RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THP2	YHR167W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
THP2	YHR167W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	YFL052W	P43551	465 aa		4.65	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	TRM13	Q12383	476 aa		4.65	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	YKR018C	P36114	725 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	ARP4	P80428	489 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	REV3	P14284	1504 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	NGG1	P32494	702 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	TRM2	P33753	639 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	FKH2	P41813	862 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	HLJ1	P48353	224 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	PCL10	P53124	433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	KIN4	Q01919	800 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	NRG1	Q03125	231 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	GUD1	Q07729	489 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	THI73	Q07904	523 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	AIM39	Q08223	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	TGL5	Q12043	749 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
THP2	YHR167W	ERG4	P25340	473 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	YJR096W	P47137	282 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	SUN4	P53616	420 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	MNN4	P36044	1178 aa		4.6	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	KTR4	P38131	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	YBR053C	P38235	358 aa		4.6	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	YBR259W	P38338	688 aa		4.6	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	ECM1	P39715	212 aa		4.6	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	ELO3	P40319	345 aa		4.6	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	AIM21	P40563	679 aa		4.6	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	MUP1	P50276	574 aa		4.6	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	GPG1	P53130	126 aa		4.6	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	PUS9	Q12069	462 aa		4.6	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	DCS2	Q12123	353 aa		4.6	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	MET3	P08536	511 aa		4.59	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	CHS7	P38843	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	CKB2	P38930	258 aa		4.59	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	UBP12	P39538	1254 aa		4.59	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	PMT3	P47190	753 aa		4.59	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	MSE1	P48525	536 aa		4.59	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	MDS3	P53094	1487 aa		4.59	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	ORC4	P54791	529 aa		4.59	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.59	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	UME1	Q03010	460 aa		4.59	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	DLT1	Q04216	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
THP2	YHR167W	NUP145	P49687	1317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	YHR112C	P38716	378 aa		4.58	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	GID8	P40208	455 aa		4.58	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.58	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	YBP2	P53169	641 aa		4.58	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	GIS1	Q03833	894 aa		4.58	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	HOS4	P40480	1083 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	YIR042C	P40586	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	YGR237C	P50089	785 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	YGL081W	P53156	320 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	SLI1	P53304	468 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	MCM21	Q06675	368 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	FRE5	Q08908	694 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	ALG7	P07286	448 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	GRX4	P32642	244 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	SUL1	P38359	859 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	BAP3	P41815	604 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	RET2	P43621	546 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	AMA1	P50082	593 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	RNT1	Q02555	471 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	GAD1	Q04792	585 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	ADY4	Q05955	493 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
THP2	YHR167W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.7 ms