RNA–Protein interactions for RNA: YBL048W

RRT1, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene RRT1, Length 312 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRT1	YBL048W	CTR1	P49573	406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RRT1	YBL048W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RRT1	YBL048W	BDH2	P39713	417 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRT1	YBL048W	ARG2	P40360	574 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRT1	YBL048W	ATP25	Q03153	612 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RRT1	YBL048W	PAC2	P39937	518 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRT1	YBL048W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RRT1	YBL048W	SEC5	P89102	971 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRT1	YBL048W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RRT1	YBL048W	LYS9	P38999	446 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	MTL1	P53214	551 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	FHN1	P53279	174 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	ATG4	P53867	494 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	TAF8	Q03750	510 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	CIT1	P00890	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	ORC2	P32833	620 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	FMO1	P38866	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	VPS34	P22543	875 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	SFB3	P38810	929 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
RRT1	YBL048W	NUP60	P39705	539 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	ALG2	P43636	503 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	MET7	Q08645	548 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	DIF1	O13577	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	YHR112C	P38716	378 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	SHR5	P41912	237 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	MRK1	P50873	501 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	RAD4	P14736	754 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	PHO11	P35842	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	PHO12	P38693	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	YBP2	P53169	641 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	RIM13	Q03792	727 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	SEG1	Q04279	960 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	OSW1	Q08692	278 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	MLH3	Q12083	715 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	BET3	P36149	193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	HUL4	P40985	892 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RRT1	YBL048W	SPC29	P33419	253 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	MCM21	Q06675	368 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.5	□□□□□ -1.69	not detected
RRT1	YBL048W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	MUP3	P38734	546 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	GAT1	P43574	510 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	FUB1	P25659	250 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	LTP1	P40347	161 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	ALY2	P47029	1046 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	RTA1	P53047	317 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	FLC1	Q08967	793 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	PER1	P25625	357 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	GMH1	P36125	273 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	TIM54	P47045	478 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	BNA2	P47125	453 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	ORC4	P54791	529 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
RRT1	YBL048W	SET3	P36124	751 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RRT1	YBL048W	APT2	P36973	181 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RRT1	YBL048W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
RRT1	YBL048W	GET2	P40056	285 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RRT1	YBL048W	USV1	Q12132	391 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RRT1	YBL048W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RRT1	YBL048W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
RRT1	YBL048W	CAN1	P04817	590 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RRT1	YBL048W	PEX1	P24004	1043 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RRT1	YBL048W	YUR1	P26725	428 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RRT1	YBL048W	PTP1	P25044	335 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RRT1	YBL048W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
RRT1	YBL048W	GID8	P40208	455 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RRT1	YBL048W	REC102	Q02721	264 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RRT1	YBL048W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7

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