RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 PIP4K2BP78356 416 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 TNP2Q05952 138 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 TMEM94Q12767 1356 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 NLRP8Q86W28 1048 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 PTPRUQ92729 1446 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.16□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 TRPM2O94759 1503 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 TOM1O60784 492 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 EID1Q9Y6B2 187 aa8.15□□□□□ -1.1
HERC3-212ENST00000597259 DIP2AQ14689 1571 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 HFM1A2PYH4 1435 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 POM121CA8CG34 1229 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 PIK3R2O00459 728 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 ADH6P28332 368 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 SIRT1Q96EB6 747 aa8.14□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 KIF1BO60333 1816 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 RAD21O60216 631 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 TRIM11Q96F44 468 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 STRN4Q9NRL3 753 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.13□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 DOC2BQ14184 412 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 FAM182BQ5T319 152 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 ZIC5Q96T25 663 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 TBX22Q9Y458 520 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 PPLO60437 1756 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 IFT172Q9UG01 1749 aa8.12□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.11□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 NALCNQ8IZF0 1738 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 FAM157BP0CG42 384 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 MTFR1Q15390 333 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 METP08581 1390 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 PIK3R4Q99570 1358 aa8.1□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 A6NJY4 79 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 PIK3CDO00329 1044 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 CDK2AP1O14519 115 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 WASHC4Q2M389 1173 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 MAP7D1Q3KQU3 841 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 PLVAPQ9BX97 442 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 CABP1Q9NZU7 370 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 PHLPP1O60346 1717 aa8.09□□□□□ -1.11
HERC3-212ENST00000597259 TXLNAP40222 546 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa8.08□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 EFSO43281 561 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP8.07□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 NHSL1Q5SYE7 1610 aa8.07□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 PRAG1Q86YV5 1406 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 BICDL1Q6ZP65 573 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 MARK1Q9P0L2 795 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa8.06□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 MST1RQ04912 1400 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 LRP6O75581 1613 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 LAMC1P11047 1609 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 SEMA3FQ13275 785 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 MDFIQ99750 246 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 ALG2Q9H553 416 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 SLAIN2Q9P270 581 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 MSH6P52701 1360 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 SHPRHQ149N8 1683 aa8.05□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 A6NJR5 290 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
HERC3-212ENST00000597259 GATA4P43694 442 aa8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms