RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 NUCB1Q02818 461 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 DYDC1Q8WWB3 177 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 JDP2Q8WYK2 163 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 UBXN4Q92575 508 aa7.33□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC102BQ68D86 513 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 LUZP1Q86V48 1076 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 FSIP1Q8NA03 581 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 BICD1Q96G01 975 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 MAST3O60307 1309 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 TUBB4BP68371 445 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 HOMER2Q9NSB8 354 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 STAT6P42226 847 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 SIRT1Q96EB6 747 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 SLC26A6Q9BXS9 759 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 GLT8D2Q9H1C3 349 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 TSNARE1Q96NA8 513 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 GJB2P29033 226 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 GNA11P29992 359 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 CCT2P78371 535 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa7.32□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 ADGRL2O95490 1459 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 SELENOOQ9BVL4 669 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 STX8Q9UNK0 236 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 CHMP4BP1P59074 171 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 UVSSAQ2YD98 709 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 MSANTD4Q8NCY6 345 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 TET3O43151 1660 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 KDM5DQ9BY66 1539 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 KRT13P13646 458 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 IP6K1Q92551 441 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 IMPG2Q9BZV3 1241 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 ACTN2P35609 894 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 PPP1R2P41236 205 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 PARP10Q53GL7 1025 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 ATL3Q6DD88 541 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 SYCE3A1L190 88 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 PPM1EQ8WY54 764 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 IFFO1Q0D2I5 559 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 MICU3Q86XE3 530 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 FAM107BQ9H098 131 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 VAT1LQ9HCJ6 419 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 PAG1Q9NWQ8 432 aa7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 SUPT20HQ8NEM7 779 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 DENND2AQ9ULE3 1009 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 CEP83Q9Y592 693 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 PRC1O43663 620 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 LDHBP07195 334 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 CAMK4Q16566 473 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 MICALCLQ6ZW33 695 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 COPS6Q7L5N1 327 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 BICDL2A1A5D9 508 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 SYKP43405 635 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 CLIP2Q9UDT6 1046 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 SYNMO15061 1565 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 TMCO3Q6UWJ1 677 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 TBX22Q9Y458 520 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 KRT2P35908 639 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 SPAG1Q07617 926 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 CHRNA2Q15822 529 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 SHTN1A0MZ66 631 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 MAP3K9P80192 1104 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 ATP8B2P98198 1209 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 TAF3Q5VWG9 929 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 LINS1Q8NG48 757 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 SYNCQ9H7C4 482 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 SBNO1A3KN83 1393 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 GUCY1B3Q02153 619 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-226ENST00000546160 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
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