RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	VPS18	Q9P253	973 aa		11.39	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	RXRA	P19793	462 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM29	Q14134	588 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	NECTIN1	Q15223	517 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	CCP110	O43303	1012 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	AOX1	Q06278	1338 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	CAPN2	P17655	700 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		11.38	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	ZSCAN12	O43309	604 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	FANCC	Q00597	558 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC39A6	Q13433	755 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	SPECC1	Q5M775	1068 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	GPATCH11	Q8N954	259 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	DESI2	Q9BSY9	194 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	MAP4K1	Q92918	833 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	SUCLG2	Q96I99	432 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP1A3	P13637	1013 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	TRDN	Q13061	729 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	SPTLC2	O15270	562 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	GLI2	P10070	1586 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	NDUFA8	P51970	172 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	ST3GAL1	Q11201	340 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	SCRN1	Q12765	414 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	ZSCAN26	Q16670	478 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	CBFA2T2	O43439	604 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	ABCC3	O15438	1527 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	ELP1	O95163	1332 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	GRM8	O00222	908 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	SYK	P43405	635 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		11.36	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	ADGRB2	O60241	1585 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	TFCP2	Q12800	502 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	PROSER3	Q2NL68	480 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	CNNM3	Q8NE01	707 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	ST5	P78524	1137 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	REST	Q13127	1097 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	SHROOM2	Q13796	1616 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	CCZ1B	P86790	482 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	MTX1	Q13505	466 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	IQCB1	Q15051	598 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	SYCP1	Q15431	976 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	CLIC4	Q9Y696	253 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF202	O95125	648 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	STX17	P56962	302 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	PSME1	Q06323	249 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	SMARCE1	Q969G3	411 aa		11.34	□□□□□ -0.59
ERCC3-208	ENST00000491292	TRIM66	O15016	1216 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ERCC3-208	ENST00000491292	TPM1	P09493	284 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ERCC3-208	ENST00000491292	TIMM10	P62072	90 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ERCC3-208	ENST00000491292	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ERCC3-208	ENST00000491292	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
ERCC3-208	ENST00000491292	HINFP	Q9BQA5	517 aa		11.33	□□□□□ -0.6

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