RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031145.6

Pdcl2-201, Transcript of Phosducin-like protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdcl2, Length 1,181 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pip5k1aP70182 546 aa10.58□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zscan10Q3URR7 782 aa10.58□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Igsf1Q7TQA1 1317 aa10.58□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Scn7aB1AYL1 1681 aa10.57□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 A530084C06RikQ3UTW2 186 aa10.57□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Chmp3Q9CQ10 224 aa10.57□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Q9CYS6 286 aa10.57□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Usp21Q9QZL6 566 aa10.57□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa10.56□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ppef1O35655 650 aa10.56□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa10.56□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Map2P20357 1828 aa10.56□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa10.56□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fyb2A2A995 729 aa10.55□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm13101A2ASJ0 481 aa10.55□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm7138L7N2C3 230 aa10.55□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Alx3O70137 343 aa10.55□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Magea6O89010 325 aa10.55□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 ArsbP50429 534 aa10.55□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Yy1Q00899 414 aa10.55□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 DmknQ6P253 517 aa10.55□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Magea3Q6T340 320 aa10.55□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Chmp7Q8R1T1 451 aa10.55□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Trip6Q9Z1Y4 480 aa10.55□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa10.55□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm3238W4VSP7 230 aa10.55□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ptpn23Q6PB44 1692 aa10.54□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Krtap28-13A0A087WQP5 138 aa10.54□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ppp1r15aP17564 657 aa10.54□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Smarcc1P97496 1104 aa10.54□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rnf180Q3U827 592 aa10.54□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa10.54□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Asic4Q7TNS7 539 aa10.54□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rhbdd1Q8BHC7 315 aa10.54□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Col23a1Q8K4G2 532 aa10.54□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ms4a4dQ99N05 225 aa10.54□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ogfod3Q9D136 315 aa10.54□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Phkg2Q9DB30 406 aa10.54□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 FocadA2AKG8 1798 aa10.53□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gpr162Q3UN16 588 aa10.53□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 ClspnQ80YR7 1315 aa10.53□□□□□ -0.72
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tial1P70318 392 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 ErfeQ6PGN1 340 aa10.52□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Miga2Q8BK03 593 aa10.52□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pdzd9Q9D9M4 266 aa10.52□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm13023A2A8N2 498 aa10.51□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mcm10Q0VBD2 885 aa10.51□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Trim28Q62318 834 aa10.51□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ints5Q8CHT3 1018 aa10.51□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Znrd1-asQ8R0E5 213 aa10.51□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Atg3Q9CPX6 314 aa10.51□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 HypkQ9CR41 129 aa10.51□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa10.5□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fbxo18Q8K2I9 1042 aa10.5□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hps4Q99KG7 671 aa10.5□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zfp777B9EKF4 885 aa10.49□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Nkpd1Q0VF94 599 aa10.49□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dcaf5Q80T85 946 aa10.49□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ccdc155Q80VJ8 648 aa10.49□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cdan1Q8CC12 1239 aa10.49□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa10.49□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Crb1Q8VHS2 1405 aa10.49□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam171a2A2A699 822 aa10.48□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 PalmQ9Z0P4 383 aa10.48□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 TnikP83510 1323 aa10.48□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Parp14Q2EMV9 1817 aa10.47□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 NfiaQ02780 532 aa10.47□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Sap130Q8BIH0 1057 aa10.47□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa10.47□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Amotl1Q9D4H4 968 aa10.47□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tbccd1Q640P7 552 aa10.46□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 CpzQ8R4V4 654 aa10.46□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ssfa2Q922B9 1252 aa10.46□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Alg13Q9D8C3 1166 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Arfgef2A2A5R2 1792 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tns2Q8CGB6 1400 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rnf223Q3UV31 285 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Plekhg5Q66T02 1073 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Phka2Q8BWJ3 1235 aa10.45□□□□□ -0.74
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cyp2c69E9PXC3 491 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mboat4P0C7A3 435 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cyp2c40P56657 491 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tlr8P58682 1032 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 MlanaQ2TA50 113 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ppp1r12cQ3UMT1 782 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cyp2c67Q569X9 491 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 GlmnQ8BZM1 596 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Stk31Q99MW1 1018 aa10.44□□□□□ -0.74
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Shank3Q4ACU6 1730 aa10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.1 ms