RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tlcd1Q99JT6 247 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nwd2Q6P5U7 1742 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Timm10P62073 90 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem109Q3UBX0 243 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ankle2Q6P1H6 964 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 R3hcc1Q8BSI6 488 aa20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cfap58B2RW38 873 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TrdnE9Q9K5 693 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyp2d34L7N463 504 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rgs9O54828 675 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Osbpl5Q9ER64 874 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tpd52l1O54818 204 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdk4P30285 303 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Exosc10P56960 887 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Card10P58660 1021 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cct2P80314 535 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmc2Q8R4P4 888 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hmgn5Q9JL35 406 aa20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NfkbibQ60778 359 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ssfa2Q922B9 1252 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa20.09■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm21985Q6P6P5 1106 aa20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccz1Q8C1Y8 480 aa20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Erc1Q99MI1 1120 aa20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc94Q9D6J3 314 aa20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sh3bp5Q9Z131 463 aa20.08■□□□□ 0.81
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ubn2Q80WC1 1314 aa20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ercc3P49135 783 aa20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trim52Q8CDV4 233 aa20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mtmr3Q8K296 1196 aa20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trim59Q922Y2 403 aa20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mrpl44Q9CY73 333 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ifi35Q9D8C4 286 aa20.08■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Snw1Q9CSN1 536 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Syt10Q9R0N4 523 aa20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sos2Q02384 1333 aa20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm973E9Q295 1059 aa20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RgmbQ7TQ33 436 aa20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam102bQ8BQS4 339 aa20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa20.07■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dusp10Q9ESS0 483 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Shisa4Q8CA71 197 aa20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mrc1Q61830 1456 aa20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp1a3Q6PIC6 1013 aa20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BrapQ99MP8 591 aa20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp251Q6PCX8 632 aa20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pms1Q8K119 917 aa20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc112A0AUP1 442 aa20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm7361D3Z6R1 267 aa20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm1979E9QAN3 267 aa20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm5862K7N5V5 267 aa20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm10220K7N660 267 aa20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Clec11aO88200 328 aa20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trim30aP15533 496 aa20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Flad1Q8R123 492 aa20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Col18a1P39061 1774 aa20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AK157302I3ITR1 129 aa20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdkn1cP49919 348 aa20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 IbspQ61711 324 aa20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sass6Q80UK7 654 aa20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnaaf2Q8BPI1 814 aa20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Alg3Q8K2A8 438 aa20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Isca1Q9D924 129 aa20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc4a1P04919 929 aa20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RdxP26043 583 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp2b3Q0VF55 1220 aa20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fsd1Q7TPM6 496 aa20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc5a1Q8C3K6 665 aa20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atad2Q8CDM1 1040 aa20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cnpy2Q9QXT0 182 aa20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rrp1P56183 494 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Golph3lQ8R088 285 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dhx40Q6PE54 779 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hook1Q8BIL5 728 aa20.02■□□□□ 0.79
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ints5Q8CHT3 1018 aa20.02■□□□□ 0.79
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Speer4bQ9D9F7 267 aa20.02■□□□□ 0.79
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp2b1G5E829 1220 aa20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zpr1Q62384 459 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.9 ms