RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 DNAJB9Q9UBS3 223 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 CDH10Q9Y6N8 788 aa19.35■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 BHLHE40O14503 412 aa19.34■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 SOCS2O14508 198 aa19.34■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 TIPRLO75663 272 aa19.34■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 CD8AP01732 235 aa19.34■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 CTLA4P16410 223 aa19.34■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 GIPRP48546 466 aa19.34■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 CDH11P55287 796 aa19.34■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 DEFB113Q30KQ7 82 aa19.34■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 GIPC3Q8TF64 312 aa19.34■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 FOXC2Q99958 501 aa19.34■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 EDARQ9UNE0 448 aa19.34■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 ARID1AO14497 2285 aa19.34■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa19.34■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 USF3Q68DE3 2245 aa19.34■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 ARRDC5A6NEK1 342 aa19.33■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 XKRYO14609 159 aa19.33■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 UBL3O95164 117 aa19.33■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 NR2C1P13056 603 aa19.33■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 HGFACQ04756 655 aa19.33■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 NPRL3Q12980 569 aa19.33■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 FAM27BQ5VT28 67 aa19.33■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 LRRC18Q8N456 261 aa19.33■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 DDOQ99489 341 aa19.33■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 IFT27Q9BW83 186 aa19.33■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 SYT4Q9H2B2 425 aa19.33■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 YY1AP1Q9H869 796 aa19.33■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 ARMC1Q9NVT9 282 aa19.33■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 REV1Q9UBZ9 1251 aa19.33■□□□□ 0.69
SYF2-201ENST00000236273 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa19.32■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 DCTN6O00399 190 aa19.32■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 GNGT2O14610 69 aa19.32■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 MGRN1O60291 552 aa19.32■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 NPR2P20594 1047 aa19.32■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 PRKACGP22612 351 aa19.32■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 ART1P52961 327 aa19.32■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 ADCK1Q86TW2 530 aa19.32■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 FBXO17Q96EF6 278 aa19.32■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 CCL19Q99731 98 aa19.32■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 NUAK2Q9H093 628 aa19.32■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 LAMP3Q9UQV4 416 aa19.32■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 OVOL3O00110 214 aa19.31■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 IDH3BO43837 385 aa19.31■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 FARS2O95363 451 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 ZNF35P13682 527 aa19.31■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 RAB39AQ14964 217 aa19.31■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 SGCAQ16586 387 aa19.31■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa19.31■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 SLC16A14Q7RTX9 510 aa19.31■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 DTX2Q86UW9 622 aa19.31■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 OR4K13Q8NH42 304 aa19.31■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 PIGTQ969N2 578 aa19.31■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 TSSK2Q96PF2 358 aa19.31■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 NMNAT3Q96T66 252 aa19.31■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 DHRS9Q9BPW9 319 aa19.31■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 ATP23Q9Y6H3 246 aa19.31■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 CRYAAP02489 173 aa19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 SERPINA5P05154 406 aa19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 GSTM3P21266 225 aa19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 LAP3P28838 519 aa19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 TTKP33981 857 aa19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 COX10Q12887 443 aa19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 UGT2A3Q6UWM9 527 aa19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 DPPA2Q7Z7J5 298 aa19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 DEPDC4Q8N2C3 294 aa19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 NPEPL1Q8NDH3 523 aa19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 OR4Q3Q8NH05 313 aa19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 FOXN4Q96NZ1 517 aa19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 SNX18Q96RF0 628 aa19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 POLE4Q9NR33 117 aa19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 AP4S1Q9Y587 144 aa19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 ITPR3Q14573 2671 aa19.3■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 OR6C68A6NDL8 312 aa19.29■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 SLC16A7O60669 478 aa19.29■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 ENTPD5O75356 428 aa19.29■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 SOX14O95416 240 aa19.29■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 PAX1P15863 534 aa19.29■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa19.29■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 LEG1Q6P5S2 330 aa19.29■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 OR6V1Q8N148 313 aa19.29■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 LNX2Q8N448 690 aa19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms