RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489571.5

PGAP2-223, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 2

Gene PGAP2, Length 879 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-223	ENST00000489571	RIN1	Q13671	783 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	SLC36A2	Q495M3	483 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	LRP11	Q86VZ4	500 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	SYT14	Q8NB59	555 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	PRRC1	Q96M27	445 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	SOX7	Q9BT81	388 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	C1orf198	Q9H425	327 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	RNF121	Q9H920	327 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	CMTM6	Q9NX76	183 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	FZR1	Q9UM11	496 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	LRP5L	A4QPB2	252 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	RNF212B	A8MTL3	300 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	LILRA1	O75019	489 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	ALDH3B1	P43353	468 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	CHN2	P52757	468 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	SEC24C	P53992	1094 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	ST3GAL3	Q11203	375 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	C10orf128	Q5T292	105 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	LZIC	Q8WZA0	190 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	CDH20	Q9HBT6	801 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571		A0A1W2PPW3	197 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	MGRN1	O60291	552 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	SLC2A10	O95528	541 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	SNAP29	O95721	258 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	TGFA	P01135	160 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	FAM157B	P0CG42	384 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	LYNX1	P0DP58	116 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	CCL2	P13500	99 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	LAPTM4A	Q15012	233 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	HPS1	Q92902	700 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	SNX18	Q96RF0	628 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	DUSP13	Q9UII6	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	PTH	P01270	115 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	HPX	P02790	462 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	COX4I1	P13073	169 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	IFI30	P13284	250 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	FUT4	P22083	530 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	IL2RG	P31785	369 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	IFNA8	P32881	189 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	PLP2	Q04941	152 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	LIPE	Q05469	1076 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	FMOD	Q06828	376 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	CD47	Q08722	323 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	TAF11	Q15544	211 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	TRIP10	Q15642	601 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	ALG10	Q5BKT4	473 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	LRRC18	Q8N456	261 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	OR51B6	Q9H340	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	SIAE	Q9HAT2	523 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	IGHM	P01871	453 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	IFNW1	P05000	195 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	NAT2	P11245	290 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	NR2C1	P13056	603 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF250	P15622	560 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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