RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
NME4-209ENST00000460297 FAM215AQ9Y5M1 114 aa21.46■■□□□ 1.03
NME4-209ENST00000460297 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa21.46■■□□□ 1.03
NME4-209ENST00000460297 CACNA1BQ00975 2339 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 A0A087WXM4 84 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 TRIM64CA6NLI5 447 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 J3QRE1 110 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 SLC43A1O75387 559 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 SBK2P0C263 348 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 AGTR1P30556 359 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 DNM1P34Q6PK57 102 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 SEM1Q6ZVN7 128 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 PRSS48Q7RTY5 328 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 SPARTQ8N0X7 666 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 FNDC8Q8TC99 324 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 NSMAFQ92636 917 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 TMEM80Q96HE8 168 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 ZNF835Q9Y2P0 537 aa21.45■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 IGSF10Q6WRI0 2623 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 FIGNL2A6NMB9 653 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 UPK3AO75631 287 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 EDN3P14138 238 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 ATP6V1E1P36543 226 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.028e-6■■□□□ 11.6
NME4-209ENST00000460297 TMEM154Q6P9G4 183 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 GCNT2Q8N0V5 402 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 PARPBPQ9NWS1 579 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 TAS2R16Q9NYV7 291 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 SCOCQ9UIL1 159 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 TVP23AA6NH52 213 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 SELENOFO60613 162 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 FADS2O95864 444 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 PTGER4P35408 488 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 CENPAP49450 140 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 GUSBP1Q15486 140 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 RPRMLQ8N4K4 120 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 GLRX2Q9NS18 164 aa21.44■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 IRGMA1A4Y4 181 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 SLC19A2O60779 497 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 RAB36O95755 333 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 TFP02787 698 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 NR2C1P13056 603 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 DCKP27707 260 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 GLO1Q04760 184 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 POU4F2Q12837 409 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 C1orf185Q5T7R7 199 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 OTPQ5XKR4 325 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 C3P1Q6ZMU1 363 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 LINGO2Q7L985 606 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 TIGD4Q8IY51 512 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 POMGNT2Q8NAT1 580 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 MARCH7Q9H992 704 aa21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 MPZL1O95297 269 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 IGHA1P01876 353 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 NFATC3Q12968 1075 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 C10orf128Q5T292 105 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 TSPO2Q5TGU0 170 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 DOLPP1Q86YN1 238 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 SLC26A10Q8NG04 563 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 CPT1CQ8TCG5 803 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 TM9SF2Q99805 663 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 CDCA4Q9BXL8 241 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 ULBP2Q9BZM5 246 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 WDR76Q9H967 626 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 SNX5Q9Y5X3 404 aa21.42■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 PRRG2O14669 202 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 TOXO94900 526 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 IGHV3-9P01782 118 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 HLA-DQA2P01906 255 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 GAAP10253 952 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 HCCSP53701 268 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 TUBA4AP68366 448 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 IRF3Q14653 427 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 GLB1L2Q8IW92 636 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 SLC7A10Q9NS82 523 aa21.41■■□□□ 1.02
NME4-209ENST00000460297 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms