RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438055.5

TTC3-209, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 5

Gene TTC3, Length 3,606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-209ENST00000438055 AMELYQ99218 206 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 SLX1AQ9BQ83 275 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 OR11A1Q9GZK7 315 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 S1PR5Q9H228 398 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 CENPMQ9NSP4 180 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 GLTPQ9NZD2 209 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 USP34Q70CQ2 3546 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 LEUTXA8MZ59 168 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 ARPC5O15511 151 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 PRAF2O60831 178 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 FOXL2P58012 376 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 SKP2Q13309 424 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 CAMK2BQ13554 666 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 LRFN4Q6PJG9 635 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 CCDC74AQ96AQ1 378 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 CKLFQ9UBR5 152 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 MKL2Q9ULH7 1088 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 C4BPBP20851 252 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 PPICP45877 212 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 POU3F4P49335 361 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 ZNF117Q03924 483 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 EGR4Q05215 589 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 TOR2AQ5JU69 321 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 MIB2Q96AX9 1013 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 EXO5Q9H790 373 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 LOC100509620A0A075B734 347 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 KDM4BO94953 1096 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 CD2P06729 351 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 ZNF248Q8NDW4 579 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 VCANP13611 3396 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 ARID1AO14497 2285 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 TRIOO75962 3097 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 POM121CA8CG34 1229 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 TEX46H3BTG2 121 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 UPK3AO75631 287 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 ZP1P60852 638 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 RAB30Q15771 203 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 GPR137Q96N19 417 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 SLC46A1Q96NT5 459 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 PTTG3PQ9NZH4 202 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 DHDHQ9UQ10 334 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 ABCA7Q8IZY2 2146 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 IL33O95760 270 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 DNASE1L1P49184 302 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 ETFDHQ16134 617 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 ACKR1Q16570 336 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 SLC29A4Q7RTT9 530 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 MAP6Q96JE9 813 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 TMEM212A6NML5 194 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 CALCBP10092 127 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 MYF5P13349 255 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 PGCP20142 388 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 SLC37A1P57057 533 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 RAB11BQ15907 218 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 NHLRC1Q6VVB1 395 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 ZDHHC12Q96GR4 267 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 CMKLR1Q99788 373 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 B3GNT4Q9C0J1 378 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 CA10Q9NS85 328 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 SPEF1Q9Y4P9 236 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 CTDSPLO15194 276 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 AHSA1O95433 338 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 SLC25A1P53007 311 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 OPCMLQ14982 345 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 WDR38Q5JTN6 314 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 GPR139Q6DWJ6 353 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 NDUFAF7Q7L592 441 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 DUSP19Q8WTR2 217 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 C5orf34Q96MH7 638 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 NUDT9Q9BW91 350 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 STEAP1Q9UHE8 339 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 GMEB2Q9UKD1 530 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 OR4C45A6NMZ5 311 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 C2CD4DB7Z1M9 353 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 RGS11O94810 467 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 CFDP00746 253 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 ALOX5APP20292 161 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 CD38P28907 300 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 EFNB2P52799 333 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 FBXW4P57775 412 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC3-209ENST00000438055 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms