RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	FGGY	Q96C11	551 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	DERL3	Q96Q80	235 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	GSX2	Q9BZM3	304 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PPA2	Q9H2U2	334 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CHRD	Q9H2X0	955 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	C1orf198	Q9H425	327 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	EHF	Q9NZC4	300 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0A6YYD5	115 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0A6YYJ9	748 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CIB4	A0PJX0	185 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193		G3V3Y1	287 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	GABARAP	H6UMI1	98 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	WDPCP	O95876	746 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	UBB	P0CG47	229 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	LIMS3	P0CW19	117 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	LIMS4	P0CW20	117 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PPP3CB	P16298	524 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	GABRB1	P18505	474 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	7.39	□□□□□ -1.23	4e-7	■■■■□ 20.3
NEK1-208	ENST00000512193	CRYBB2	P43320	205 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	AKR1C2	P52895	323 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	HMGA2	P52926	109 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	BID	P55957	195 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TAS2R31	P59538	309 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	RHEB	Q15382	184 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	AGBL4	Q5VU57	503 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	RNF170	Q96K19	258 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF649	Q9BS31	505 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	EMC6	Q9BV81	110 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CEP250	Q9BV73	2442 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	RTTN	Q86VV8	2226 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TSPAN11	A1L157	253 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TNFRSF10C	O14798	259 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SOD1	P00441	154 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	DBH	P09172	617 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SDHB	P21912	280 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CDK2	P24941	298 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	BDKRB2	P30411	391 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	S100A11	P31949	105 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	KCNAB1	Q14722	419 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TSC22D1	Q15714	1073 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SLC36A2	Q495M3	483 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR4K15	Q8NH41	348 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	IFNA5	P01569	189 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	IGHA2	P01877	340 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	RAB5B	P61020	215 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CDK5R1	Q15078	307 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	BCL2A1	Q16548	175 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SULF2	Q8IWU5	870 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	IL20	Q9NYY1	176 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	BLACE	A4D250	179 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	BRINP1	O60477	761 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	DPM1	O60762	260 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	HSD17B7	P56937	341 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	LRRC18	Q8N456	261 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	NINJ1	Q92982	152 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SGCZ	Q96LD1	299 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TEX101	Q9BY14	249 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OBP2A	Q9NY56	170 aa		7.38	□□□□□ -1.23

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