RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 OR1J4Q8NGS1 313 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 SNX33Q8WV41 574 aa14.63□□□□□ -0.07
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HPS1-202ENST00000338546 GALNT8Q9NY28 637 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 KNTC1P50748 2209 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 GABRPO00591 440 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 SELENOFO60613 162 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 SERPINI2O75830 405 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 SERPINA3P01011 423 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 CD40LGP29965 261 aa14.62□□□□□ -0.07
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HPS1-202ENST00000338546 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
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HPS1-202ENST00000338546 ZNF45Q02386 682 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 TLE3Q04726 772 aa14.62□□□□□ -0.07
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HPS1-202ENST00000338546 MYBPHQ13203 477 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 ACER2Q5QJU3 275 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 C16orf87Q6PH81 154 aa14.62□□□□□ -0.07
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HPS1-202ENST00000338546 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.62□□□□□ -0.07
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HPS1-202ENST00000338546 SH3GL3Q99963 347 aa14.62□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 SYT4Q9H2B2 425 aa14.62□□□□□ -0.07
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HPS1-202ENST00000338546 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa14.62□□□□□ -0.07
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HPS1-202ENST00000338546 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 SULT1C4O75897 302 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 CDRT1O95170 752 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 P04436 131 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 BMP4P12644 408 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 DPP4P27487 766 aa14.61□□□□□ -0.07
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HPS1-202ENST00000338546 ZNF684Q5T5D7 378 aa14.61□□□□□ -0.07
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HPS1-202ENST00000338546 HDDC2Q7Z4H3 204 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 CDC20BQ86Y33 519 aa14.61□□□□□ -0.07
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HPS1-202ENST00000338546 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 AP3S1Q92572 193 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 TMED9Q9BVK6 235 aa14.61□□□□□ -0.07
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HPS1-202ENST00000338546 ZNF12P17014 697 aa14.6□□□□□ -0.07
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HPS1-202ENST00000338546 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 GHDCQ8N2G8 530 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 ASB10Q8WXI3 467 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 PHYHIPQ92561 330 aa14.6□□□□□ -0.07
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HPS1-202ENST00000338546 C5orf34Q96MH7 638 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 TSSK2Q96PF2 358 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 INTS14Q96SY0 518 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 NPIPA1Q9UND3 350 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 H3BML4 177 aa14.6□□□□□ -0.07
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HPS1-202ENST00000338546 IL11P20809 199 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 SDC2P34741 201 aa14.6□□□□□ -0.07
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HPS1-202ENST00000338546 SLC35A1P78382 337 aa14.6□□□□□ -0.07
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HPS1-202ENST00000338546 MARCH9Q86YJ5 346 aa14.6□□□□□ -0.07
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HPS1-202ENST00000338546 RPS4Y2Q8TD47 263 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 ASB17Q8WXJ9 295 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 PSMF1Q92530 271 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 MIB2Q96AX9 1013 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 COPS3Q9UNS2 423 aa14.6□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 SLC35F4A4IF30 521 aa14.59□□□□□ -0.07
HPS1-202ENST00000338546 GJE1A6NN92 205 aa14.59□□□□□ -0.07
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