RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494465.5

ATG4B-225, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 2,365 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-225ENST00000494465 SLC25A1P53007 311 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 ACTC1P68032 377 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 ACTA1P68133 377 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 PON3Q15166 354 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SGCBQ16585 318 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 EMC4Q5J8M3 183 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 RERGLQ9H628 205 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 METTL7AQ9H8H3 244 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 PALMDQ9NP74 551 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 PISDQ9UG56 409 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 PADI1Q9ULC6 663 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 VDAC3Q9Y277 283 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 E9PI62 339 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 RPS18P62269 152 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 LGALS3BPQ08380 585 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.021e-6■□□□□ 11.1
ATG4B-225ENST00000494465 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 LCN1P1Q5VSP4 162 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 LYPD4Q6UWN0 246 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SYT14Q8NB59 555 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 OR5J2Q8NH18 312 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 TSSK2Q96PF2 358 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 TAAR9Q96RI9 348 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SH3GL3Q99963 347 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 ZPBPQ9BS86 351 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 EDEM2Q9BV94 578 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 DDA1Q9BW61 102 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 GRHPRQ9UBQ7 328 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 PCSK5Q92824 1860 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 C9orf172C9J069 976 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 MASP2O00187 686 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 DXOO77932 396 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 MSX1P28360 303 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 GRPRP30550 384 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 OR12D2P58182 307 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 E2F1Q01094 437 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 FOXF1Q12946 379 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 GPR50Q13585 617 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 INAQ16352 499 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 C5orf46Q6UWT4 87 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 NDUFAF7Q7L592 441 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 JAZF1Q86VZ6 243 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 RELTQ969Z4 430 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 C4orf36Q96KX1 117 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 TMED9Q9BVK6 235 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 DCTN6O00399 190 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SELENOFO60613 162 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 GLCEO94923 617 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 MT-ND5P03915 603 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 OR2T7P0C7T2 308 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 PYCR1P32322 319 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SOX6P35712 828 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 INSL4Q14641 139 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SLC25A53Q5H9E4 307 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 GPR139Q6DWJ6 353 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 OR2T27Q8NH04 317 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 CT55Q8WUE5 264 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 ZNF160Q9HCG1 818 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 TMEM9BQ9NQ34 198 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 TCFL5Q9UL49 500 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 FREM2Q5SZK8 3169 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SHISA8B8ZZ34 492 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 C11orf98E9PRG8 122 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 H7C1C5 153 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 EFNA2O43921 213 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 CDRT1O95170 752 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 AHSA1O95433 338 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 IL1AP01583 271 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 IL11P20809 199 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 LCN6P62502 163 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 PLPPR5Q32ZL2 321 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SLC6A19Q695T7 634 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 C16orf87Q6PH81 154 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 SLC35F2Q8IXU6 374 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 OR2M3Q8NG83 312 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-225ENST00000494465 OR6K6Q8NGW6 343 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms