RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362957.1

RNU6-1290P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1290, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1290P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FOXA1P55317 472 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ARG2P78540 354 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCDC173Q0VFZ6 552 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TRADDQ15628 312 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SGCAQ16586 387 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KLHL40Q2TBA0 621 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C1orf189Q5VU69 101 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLX4IPQ5VYV7 408 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 Q6ZRU5 148 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 VN1R4Q7Z5H5 301 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 UNC45BQ8IWX7 931 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MUC15Q8N387 334 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TTLQ8NG68 377 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 UCMAQ8WVF2 138 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 P2RX5Q93086 422 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GAL3ST1Q99999 423 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 REG4Q9BYZ8 158 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KLHL4Q9C0H6 718 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MUC13Q9H3R2 512 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PREBQ9HCU5 417 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CTPS2Q9NRF8 586 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PDRG1Q9NUG6 133 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RRN3Q9NYV6 651 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 VAX2Q9UIW0 290 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 APPL1Q9UKG1 709 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PCDHGB4Q9UN71 923 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OARD1Q9Y530 152 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 V9GY05 133 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DENND4AQ7Z401 1863 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RNF213Q63HN8 5207 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PP2D1A8MPX8 630 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FCN1O00602 326 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CLDN4O14493 209 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KMOO15229 486 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TSPAN2O60636 221 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ENTPD3O75355 529 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 YIF1AO95070 293 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HLA-DPB1P04440 258 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GSTA2P09210 222 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 XBP1P17861 261 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DTYMKP23919 212 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CXCR2P25025 360 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SOX6P35712 828 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC1A2P43004 574 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RAD52P43351 418 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PRLHRP49683 370 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 BIDP55957 195 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TAS2R31P59538 309 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CETN1Q12798 172 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 EPS8Q12929 822 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SNAPC1Q16533 368 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DPYSL2Q16555 572 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC25A52Q3SY17 297 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CRY2Q49AN0 593 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PNCKQ6P2M8 343 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DNAJC24Q6P3W2 148 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM205Q6UW68 189 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 BTNL8Q6UX41 500 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GPR142Q7Z601 462 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LYPD6Q86Y78 171 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LINC01561Q8N1V8 128 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NOXO1Q8NFA2 376 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GOLGA5Q8TBA6 731 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SETD6Q8TBK2 473 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC2A14Q8TDB8 520 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 BRSK1Q8TDC3 778 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ABHD3Q8WU67 409 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PLAC4Q8WY50 150 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 VMP1Q96GC9 406 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CAPNS2Q96L46 248 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CXorf58Q96LI9 332 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SPATA33Q96N06 139 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TSSK2Q96PF2 358 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SH3GL3Q99963 347 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KLHDC3Q9BQ90 382 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ECSITQ9BQ95 431 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms