RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 MCCC2Q9HCC0 563 aa2.86□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 ADAP2Q9NPF8 381 aa2.86□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 OPTCQ9UBM4 332 aa2.86□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 LIPGQ9Y5X9 500 aa2.86□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 SAR1BQ9Y6B6 198 aa2.86□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 TEX264Q9Y6I9 313 aa2.86□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 SPACA6W5XKT8 324 aa2.86□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 DOCK4Q8N1I0 1966 aa2.86□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 ESPL1Q14674 2120 aa2.86□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 CHD5Q8TDI0 1954 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 PKDREJQ9NTG1 2253 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 A0A1W2PP11 408 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 C15orf62A8K5M9 175 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 VGLL3A8MV65 326 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 UBXN8O00124 270 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 DVL1O14640 695 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 BCKDKO14874 412 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 PLPP2O43688 288 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 EEDO75530 441 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 TSPAN9O75954 239 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 ACSL3O95573 720 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 SMIM10L1P0DMW3 83 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 GFAPP14136 432 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 CD1DP15813 335 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 EPORP19235 508 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 NT5EP21589 574 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 GDF1P27539 372 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 HPDP32754 393 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 SPRP35270 261 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 GP5P40197 560 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC6A12P48065 614 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 FBXW4P57775 412 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 RAB10P61026 200 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 ATP6V0D1P61421 351 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 HERVK_113P63132 956 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 ERVK-8P63133 956 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 CDKL1Q00532 357 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 FOLH1Q04609 750 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 SRYQ05066 204 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 C2orf54Q08AI8 447 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 GAGE5Q13069 117 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 GAGE6Q13070 117 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 SERTAD2Q14140 314 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 TRADDQ15628 312 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 CEBPEQ15744 281 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 PIGGQ5H8A4 983 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 C1orf185Q5T7R7 199 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 WLSQ5T9L3 541 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 CES4AQ5XG92 561 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM219BQ5XKK7 198 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC22A10Q63ZE4 541 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM198Q66K66 360 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 OR4C11Q6IEV9 310 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 RGS9BPQ6ZS82 235 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 Q71RC1 249 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 BBOF1Q8ND07 529 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 MORN4Q8NDC4 146 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 OR7G3Q8NG95 312 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 OR10G3Q8NGC4 313 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 OR52I2Q8NH67 350 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 STAG3L4Q8TBR4 150 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 RDH11Q8TC12 318 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC22A8Q8TCC7 542 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 KCTD4Q8WVF5 259 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 RIT1Q92963 219 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 UCN3Q969E3 161 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 UBE2E3Q969T4 207 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 ATP6V1E2Q96A05 226 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 PHF21AQ96BD5 680 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 NXNL1Q96CM4 212 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 LRRC39Q96DD0 335 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 SMIM10Q96HG1 83 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 DACH2Q96NX9 599 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 UHRF2Q96PU4 802 aa2.85□□□□□ -1.95
ANKRD28-211ENST00000492895 RBBP8Q99708 897 aa2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms