RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000046095.9

Vsx1-201, Transcript of Visual system homeobox 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vsx1, Length 3,791 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1-201ENSMUST00000046095 RlimQ9WTV7 600 aa11.64□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Kcnd3Q9Z0V1 655 aa11.64□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Plxna4Q80UG2 1893 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ino80eA0A0U1RP99 260 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Lao1B1ARV3 523 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm8765B7ZWJ3 1017 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm5286E0CXI6 357 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 BC117090L7N257 96 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Vmn1r169L7N275 304 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Sstr5O08858 362 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 PtgdsO09114 189 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 St8sia2O35696 375 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Smpd2O70572 419 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Il1bP10749 269 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 AcheP21836 614 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Egfbp2P36368 261 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tead3P70210 439 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Map3k8Q07174 467 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm906Q3V0M1 1017 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 BocQ6AZB0 1110 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr1349Q7TQV1 317 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fam205cQ80YD3 371 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Eipr1Q8K0G5 386 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr1151Q8VFQ8 308 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Camk2gQ923T9 529 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Commd4Q9CQ02 199 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Q9CQT6 229 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cyp2u1Q9CX98 530 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 TapbpQ9R233 465 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Igkv18-36A0A075B5M9 114 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zfp442A2AQA0 667 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 ItpkbB2RXC2 942 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm4778L7N229 365 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cyp4a10O88833 509 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Nkx2-6P43688 289 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Sult2a2P50236 285 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Taf13P61216 124 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 HpQ61646 347 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cd34Q64314 382 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Carnmt1Q80UY1 400 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Timm29Q8BGX2 266 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 ZxdcQ8C8V1 858 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Nfatc4Q8K120 901 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Casc3Q8K3W3 698 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr486Q8VFD0 314 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Asb15Q8VHS6 583 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Clint1Q99KN9 631 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rnf128Q9D304 428 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fgf20Q9ESL9 211 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tmem176bQ9R1Q6 263 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 RfxankQ9Z205 269 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm3854A0A1B0GSS6 495 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm364A2AFI6 671 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr1255A2AUA4 310 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr1156A2AVC3 323 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zfp97E9PZP6 546 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr420E9Q4G0 321 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 5830473C10RikF8VQ07 620 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zfp960L7N267 546 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zfp60P16374 707 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cd48P18181 240 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 PpibP24369 216 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 SctQ08535 133 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rnft2Q3UF64 445 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Elavl3Q60900 367 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rbm38Q62176 237 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zbtb42Q811H0 420 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rxfp3Q8BGE9 472 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gtpbp3Q923K4 492 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Yipf2Q99LP8 312 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Aldh7a1Q9DBF1 539 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Copz2Q9JHH9 205 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fbxw5Q9QXW2 573 aa11.63□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr1082A0A1L1SUC9 313 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Esp34G3UXG0 151 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Vmn2r75G5E8Z7 853 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 ChrndP02716 520 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Hoxa4P06798 285 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Timp2P25785 220 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tgif1P70284 272 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ttf1Q62187 859 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Otop2Q80SX5 563 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 SynprQ8BGN8 265 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rab43Q8CG50 210 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rfc3Q8R323 356 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Nkd2Q8VE28 461 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Wdr45Q91VM3 360 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tinagl1Q99JR5 466 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Lims1Q99JW4 325 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Plxna1P70206 1894 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Sult2a3D3Z1W5 285 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 5430401F13RikE9Q328 175 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cfl1P18760 166 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zdhhc2P59267 366 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Stx4P70452 298 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Lrit2Q6PFC5 549 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rcc2Q8BK67 520 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Slc9a7Q8BLV3 726 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rell2Q8BRJ3 303 aa11.62□□□□□ -0.55
Vsx1-201ENSMUST00000046095 PcgF3Q8BTQ0 241 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.7 ms