Protein–RNA interactions for Protein: P10749

Il1b, Interleukin-1 beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il1bP10749 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Il1bP10749 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Il1bP10749 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Il1bP10749 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,2
Il1bP10749 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Il1bP10749 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Il1bP10749 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Il1bP10749 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Il1bP10749 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Il1bP10749 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Il1bP10749 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Il1bP10749 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Il1bP10749 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Il1bP10749 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Il1bP10749 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Il1bP10749 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Il1bP10749 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Il1bP10749 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Il1bP10749 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,49■■□□□ 1,83
Il1bP10749 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Il1bP10749 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Il1bP10749 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,22■■□□□ 1,79
Il1bP10749 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Il1bP10749 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Il1bP10749 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,89■■□□□ 1,74
Il1bP10749 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Il1bP10749 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Il1bP10749 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Il1bP10749 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Il1bP10749 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,71
Il1bP10749 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Il1bP10749 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Il1bP10749 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Il1bP10749 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,55■■□□□ 1,68
Il1bP10749 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Il1bP10749 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Il1bP10749 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Il1bP10749 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Il1bP10749 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Il1bP10749 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Il1bP10749 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Il1bP10749 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Il1bP10749 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Il1bP10749 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Il1bP10749 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Il1bP10749 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Il1bP10749 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Il1bP10749 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Il1bP10749 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Il1bP10749 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Il1bP10749 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Il1bP10749 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Il1bP10749 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Il1bP10749 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,01■■□□□ 1,59
Il1bP10749 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Il1bP10749 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Il1bP10749 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Il1bP10749 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Il1bP10749 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Il1bP10749 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Il1bP10749 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Il1bP10749 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Il1bP10749 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Il1bP10749 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Il1bP10749 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Il1bP10749 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Il1bP10749 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Il1bP10749 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Il1bP10749 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Il1bP10749 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Il1bP10749 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Il1bP10749 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Il1bP10749 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Il1bP10749 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,41■■□□□ 1,5
Il1bP10749 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Il1bP10749 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
Il1bP10749 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Il1bP10749 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Il1bP10749 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,29■■□□□ 1,48
Il1bP10749 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Il1bP10749 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Il1bP10749 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Il1bP10749 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Il1bP10749 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Il1bP10749 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Il1bP10749 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,44
Il1bP10749 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,07■■□□□ 1,44
Il1bP10749 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Il1bP10749 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Il1bP10749 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1,43
Il1bP10749 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Il1bP10749 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Il1bP10749 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Il1bP10749 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Il1bP10749 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Il1bP10749 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Il1bP10749 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Il1bP10749 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Il1bP10749 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,91■■□□□ 1,42
Il1bP10749 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms