Protein–RNA interactions for Protein: P10749

Il1b, Interleukin-1 beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il1bP10749 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Il1bP10749 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Il1bP10749 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Il1bP10749 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Il1bP10749 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Il1bP10749 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Il1bP10749 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Il1bP10749 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Il1bP10749 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Il1bP10749 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Il1bP10749 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Il1bP10749 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Il1bP10749 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Il1bP10749 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Il1bP10749 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Il1bP10749 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Il1bP10749 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Il1bP10749 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Il1bP10749 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Il1bP10749 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Il1bP10749 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Il1bP10749 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Il1bP10749 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Il1bP10749 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Il1bP10749 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Il1bP10749 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Il1bP10749 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Il1bP10749 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Il1bP10749 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Il1bP10749 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Il1bP10749 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Il1bP10749 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Il1bP10749 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Il1bP10749 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Il1bP10749 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Il1bP10749 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Il1bP10749 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Il1bP10749 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Il1bP10749 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Il1bP10749 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Il1bP10749 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Il1bP10749 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Il1bP10749 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Il1bP10749 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Il1bP10749 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Il1bP10749 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Il1bP10749 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Il1bP10749 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Il1bP10749 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Il1bP10749 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Il1bP10749 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Il1bP10749 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Il1bP10749 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Il1bP10749 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Il1bP10749 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Il1bP10749 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Il1bP10749 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Il1bP10749 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Il1bP10749 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Il1bP10749 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Il1bP10749 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Il1bP10749 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Il1bP10749 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Il1bP10749 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Il1bP10749 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Il1bP10749 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Il1bP10749 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Il1bP10749 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Il1bP10749 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Il1bP10749 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Il1bP10749 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Il1bP10749 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Il1bP10749 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Il1bP10749 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Il1bP10749 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Il1bP10749 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Il1bP10749 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Il1bP10749 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Il1bP10749 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Il1bP10749 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Il1bP10749 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Il1bP10749 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Il1bP10749 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Il1bP10749 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Il1bP10749 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Il1bP10749 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Il1bP10749 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Il1bP10749 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Il1bP10749 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Il1bP10749 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Il1bP10749 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Il1bP10749 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Il1bP10749 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Il1bP10749 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Il1bP10749 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Il1bP10749 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Il1bP10749 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Il1bP10749 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Il1bP10749 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Il1bP10749 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms