Protein–RNA interactions for Protein: P70452

Stx4, Syntaxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx4P70452 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Stx4P70452 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Stx4P70452 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Stx4P70452 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Stx4P70452 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Stx4P70452 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stx4P70452 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Stx4P70452 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stx4P70452 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stx4P70452 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stx4P70452 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stx4P70452 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stx4P70452 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stx4P70452 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Stx4P70452 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stx4P70452 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stx4P70452 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Stx4P70452 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Stx4P70452 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stx4P70452 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stx4P70452 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stx4P70452 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stx4P70452 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stx4P70452 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stx4P70452 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Stx4P70452 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stx4P70452 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stx4P70452 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Stx4P70452 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Stx4P70452 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Stx4P70452 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stx4P70452 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Stx4P70452 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx4P70452 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx4P70452 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx4P70452 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx4P70452 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx4P70452 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Stx4P70452 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx4P70452 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx4P70452 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx4P70452 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx4P70452 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx4P70452 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx4P70452 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Stx4P70452 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stx4P70452 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stx4P70452 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stx4P70452 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stx4P70452 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stx4P70452 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx4P70452 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stx4P70452 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stx4P70452 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stx4P70452 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx4P70452 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx4P70452 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stx4P70452 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Stx4P70452 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stx4P70452 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx4P70452 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stx4P70452 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stx4P70452 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Stx4P70452 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stx4P70452 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stx4P70452 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx4P70452 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stx4P70452 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx4P70452 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stx4P70452 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Stx4P70452 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stx4P70452 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx4P70452 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stx4P70452 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stx4P70452 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stx4P70452 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stx4P70452 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx4P70452 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx4P70452 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx4P70452 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx4P70452 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Stx4P70452 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Stx4P70452 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx4P70452 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx4P70452 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx4P70452 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx4P70452 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx4P70452 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx4P70452 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx4P70452 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx4P70452 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx4P70452 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx4P70452 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx4P70452 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx4P70452 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx4P70452 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx4P70452 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx4P70452 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx4P70452 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx4P70452 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms