Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Ino80eA0A0U1RP99 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Ino80eA0A0U1RP99 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Ino80eA0A0U1RP99 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Ino80eA0A0U1RP99 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Ino80eA0A0U1RP99 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Ino80eA0A0U1RP99 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Ino80eA0A0U1RP99 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Ino80eA0A0U1RP99 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Ino80eA0A0U1RP99 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Ino80eA0A0U1RP99 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Ino80eA0A0U1RP99 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ino80eA0A0U1RP99 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ino80eA0A0U1RP99 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ino80eA0A0U1RP99 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Ino80eA0A0U1RP99 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Ino80eA0A0U1RP99 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ino80eA0A0U1RP99 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,05■■□□□ 1,6
Ino80eA0A0U1RP99 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Ino80eA0A0U1RP99 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,81■■□□□ 1,56
Ino80eA0A0U1RP99 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
Ino80eA0A0U1RP99 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Ino80eA0A0U1RP99 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Ino80eA0A0U1RP99 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Ino80eA0A0U1RP99 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Ino80eA0A0U1RP99 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Ino80eA0A0U1RP99 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Ino80eA0A0U1RP99 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Ino80eA0A0U1RP99 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Ino80eA0A0U1RP99 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,16■■□□□ 1,46
Ino80eA0A0U1RP99 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Ino80eA0A0U1RP99 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Ino80eA0A0U1RP99 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Ino80eA0A0U1RP99 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Ino80eA0A0U1RP99 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Ino80eA0A0U1RP99 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Ino80eA0A0U1RP99 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Ino80eA0A0U1RP99 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Ino80eA0A0U1RP99 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Ino80eA0A0U1RP99 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Ino80eA0A0U1RP99 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,78■■□□□ 1,4
Ino80eA0A0U1RP99 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,76■■□□□ 1,39
Ino80eA0A0U1RP99 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ino80eA0A0U1RP99 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,68■■□□□ 1,38
Ino80eA0A0U1RP99 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Ino80eA0A0U1RP99 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Ino80eA0A0U1RP99 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,63■■□□□ 1,37
Ino80eA0A0U1RP99 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ino80eA0A0U1RP99 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,6■■□□□ 1,37
Ino80eA0A0U1RP99 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Ino80eA0A0U1RP99 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Ino80eA0A0U1RP99 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Ino80eA0A0U1RP99 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Ino80eA0A0U1RP99 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,48■■□□□ 1,35
Ino80eA0A0U1RP99 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Ino80eA0A0U1RP99 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Ino80eA0A0U1RP99 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,31■■□□□ 1,32
Ino80eA0A0U1RP99 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Ino80eA0A0U1RP99 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Ino80eA0A0U1RP99 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Ino80eA0A0U1RP99 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,2■■□□□ 1,3
Ino80eA0A0U1RP99 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Ino80eA0A0U1RP99 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Ino80eA0A0U1RP99 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ino80eA0A0U1RP99 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ino80eA0A0U1RP99 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ino80eA0A0U1RP99 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Ino80eA0A0U1RP99 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Ino80eA0A0U1RP99 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ino80eA0A0U1RP99 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ino80eA0A0U1RP99 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Ino80eA0A0U1RP99 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Ino80eA0A0U1RP99 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ino80eA0A0U1RP99 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ino80eA0A0U1RP99 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,89■■□□□ 1,25
Ino80eA0A0U1RP99 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Ino80eA0A0U1RP99 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Ino80eA0A0U1RP99 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ino80eA0A0U1RP99 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22,86■■□□□ 1,25
Ino80eA0A0U1RP99 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Ino80eA0A0U1RP99 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ino80eA0A0U1RP99 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,82■■□□□ 1,24
Ino80eA0A0U1RP99 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Ino80eA0A0U1RP99 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Ino80eA0A0U1RP99 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Ino80eA0A0U1RP99 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Ino80eA0A0U1RP99 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Ino80eA0A0U1RP99 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Ino80eA0A0U1RP99 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Ino80eA0A0U1RP99 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Ino80eA0A0U1RP99 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Ino80eA0A0U1RP99 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Ino80eA0A0U1RP99 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,61■■□□□ 1,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,9 ms