RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Acrv1	P50289	261 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gss	P51855	474 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fdft1	P53798	416 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	St3gal1	P54751	337 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Csrp2	P97314	193 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ica1	P97411	478 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Adra1b	P97717	514 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Creb1	Q01147	341 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cnn2	Q08093	305 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zdhhc11	Q14AK4	347 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmc5	Q32NZ6	967 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fpr-rs6	Q3SXG2	339 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fbxo7	Q3U7U3	523 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lbr	Q3U9G9	626 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cks1brt	Q3UNC9	96 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ckap2	Q3V1H1	664 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hormad2	Q5SQP1	306 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Spata22	Q5SV06	358 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vezf1	Q5SXC4	518 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vsig8	Q6P3A4	417 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cramp1	Q6PG95	1285 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ceacam14	Q78Y72	263 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1251	Q7TQZ3	318 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr527	Q7TRT9	305 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rab9b	Q8BHH2	201 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mob3c	Q8BJG4	216 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Arhgap25	Q8BYW1	648 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Shisa7	Q8C3Q5	558 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lrrc20	Q8CI70	184 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam199x	Q8K2D0	388 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	P2rx2	Q8K3P1	485 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1208	Q8VG47	308 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1395	Q8VGD7	317 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1	Q8VGI1	314 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc14a1	Q8VHL0	384 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Chrdl1	Q920C1	447 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Frk	Q922K9	512 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Amn	Q99JB7	458 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sytl3	Q99N48	607 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gsdmc	Q99NB5	468 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rab27b	Q99P58	218 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc5a5	Q99PN0	618 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dcun1d5	Q9CXV9	237 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	9230104L09Rik	Q9D264	133 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	4931423N10Rik	Q9D4J9	382 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem81	Q9D5K1	259 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mettl9	Q9EPL4	318 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ermap	Q9JLN5	566 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Exo1	Q9QZ11	837 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dnajc12	Q9R022	198 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Eif2s3x	Q9Z0N1	472 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Eif2s3y	Q9Z0N2	472 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sfrp4	Q9Z1N6	351 aa		3.69	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Frmpd2	A0A140LI67	1392 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cdk5rap2	Q8K389	1822 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1097	A2AVA9	315 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1156	A2AVC3	323 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zfp952	B0V2W4	504 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vmn1r5	B2RQT2	315 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mn1	D3YWE6	1297 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tstd1	E9PY03	133 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vmn2r118	E9Q1C1	853 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Enthd1	E9Q1Z2	618 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rnf165	E9QAU8	347 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm20683	H3BKJ1	410 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr738	L7N1X7	311 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vmn2r93	L7N1Z9	857 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm5724	L7N264	670 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rab17	P35292	214 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Acot8	P58137	320 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rab10	P61027	200 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mcptl	Q00356	246 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	F13b	Q07968	669 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ssbp4	Q3U4B1	363 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	H2-Eb2	Q3UUV9	287 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Amz2	Q400C8	359 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Plk3	Q60806	631 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fzd7	Q61090	572 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gstt2	Q61133	244 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dbh	Q64237	622 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	A4galt	Q67BJ4	359 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam214a	Q69ZK7	1075 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Stambpl1	Q76N33	436 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	C6.1al	Q7M757	291 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1085	Q7TR64	313 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr169	Q7TS53	313 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	4930503B20Rik	Q80ZP0	234 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Igdcc3	Q8BQC3	813 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Harbi1	Q8BR93	349 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gmppb	Q8BTZ7	360 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	BC024139	Q8BVJ3	772 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nudt9	Q8BVU5	350 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nelfb	Q8C4Y3	580 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Apoa5	Q8C7G5	368 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dcaf8	Q8N7N5	591 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc137	Q8R0K4	290 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Angptl8	Q8R1L8	198 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Atg10	Q8R1P4	215 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mitd1	Q8VDV8	249 aa		3.68	□□□□□ -1.82
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wasf3	Q8VHI6	501 aa		3.68	□□□□□ -1.82

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.4 ms