Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Cnn2Q08093 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cnn2Q08093 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cnn2Q08093 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cnn2Q08093 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnn2Q08093 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cnn2Q08093 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cnn2Q08093 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnn2Q08093 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnn2Q08093 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cnn2Q08093 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnn2Q08093 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cnn2Q08093 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cnn2Q08093 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cnn2Q08093 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnn2Q08093 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cnn2Q08093 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cnn2Q08093 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cnn2Q08093 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cnn2Q08093 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cnn2Q08093 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnn2Q08093 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnn2Q08093 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnn2Q08093 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnn2Q08093 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnn2Q08093 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnn2Q08093 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnn2Q08093 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnn2Q08093 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnn2Q08093 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnn2Q08093 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cnn2Q08093 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnn2Q08093 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cnn2Q08093 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cnn2Q08093 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cnn2Q08093 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cnn2Q08093 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnn2Q08093 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cnn2Q08093 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnn2Q08093 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnn2Q08093 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cnn2Q08093 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnn2Q08093 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnn2Q08093 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnn2Q08093 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnn2Q08093 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cnn2Q08093 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cnn2Q08093 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cnn2Q08093 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cnn2Q08093 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnn2Q08093 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnn2Q08093 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnn2Q08093 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cnn2Q08093 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cnn2Q08093 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnn2Q08093 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnn2Q08093 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnn2Q08093 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnn2Q08093 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnn2Q08093 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnn2Q08093 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnn2Q08093 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnn2Q08093 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnn2Q08093 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnn2Q08093 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnn2Q08093 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnn2Q08093 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnn2Q08093 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnn2Q08093 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnn2Q08093 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnn2Q08093 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnn2Q08093 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnn2Q08093 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnn2Q08093 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnn2Q08093 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnn2Q08093 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnn2Q08093 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnn2Q08093 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnn2Q08093 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnn2Q08093 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnn2Q08093 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnn2Q08093 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnn2Q08093 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnn2Q08093 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnn2Q08093 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnn2Q08093 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnn2Q08093 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnn2Q08093 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnn2Q08093 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnn2Q08093 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnn2Q08093 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnn2Q08093 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnn2Q08093 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnn2Q08093 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnn2Q08093 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnn2Q08093 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnn2Q08093 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnn2Q08093 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnn2Q08093 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnn2Q08093 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms