Protein–RNA interactions for Protein: Q99N48

Sytl3, Synaptotagmin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sytl3Q99N48 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Sytl3Q99N48 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sytl3Q99N48 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sytl3Q99N48 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sytl3Q99N48 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sytl3Q99N48 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sytl3Q99N48 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sytl3Q99N48 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sytl3Q99N48 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Sytl3Q99N48 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Sytl3Q99N48 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Sytl3Q99N48 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Sytl3Q99N48 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sytl3Q99N48 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sytl3Q99N48 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sytl3Q99N48 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sytl3Q99N48 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sytl3Q99N48 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sytl3Q99N48 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sytl3Q99N48 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sytl3Q99N48 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sytl3Q99N48 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sytl3Q99N48 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sytl3Q99N48 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sytl3Q99N48 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sytl3Q99N48 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sytl3Q99N48 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sytl3Q99N48 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sytl3Q99N48 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sytl3Q99N48 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sytl3Q99N48 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sytl3Q99N48 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sytl3Q99N48 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sytl3Q99N48 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sytl3Q99N48 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sytl3Q99N48 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sytl3Q99N48 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sytl3Q99N48 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sytl3Q99N48 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sytl3Q99N48 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sytl3Q99N48 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sytl3Q99N48 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sytl3Q99N48 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sytl3Q99N48 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sytl3Q99N48 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sytl3Q99N48 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sytl3Q99N48 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sytl3Q99N48 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sytl3Q99N48 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sytl3Q99N48 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sytl3Q99N48 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sytl3Q99N48 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sytl3Q99N48 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sytl3Q99N48 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sytl3Q99N48 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sytl3Q99N48 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sytl3Q99N48 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sytl3Q99N48 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sytl3Q99N48 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sytl3Q99N48 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sytl3Q99N48 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sytl3Q99N48 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sytl3Q99N48 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sytl3Q99N48 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sytl3Q99N48 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sytl3Q99N48 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sytl3Q99N48 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sytl3Q99N48 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sytl3Q99N48 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sytl3Q99N48 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sytl3Q99N48 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sytl3Q99N48 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sytl3Q99N48 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sytl3Q99N48 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sytl3Q99N48 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sytl3Q99N48 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sytl3Q99N48 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sytl3Q99N48 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sytl3Q99N48 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sytl3Q99N48 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sytl3Q99N48 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sytl3Q99N48 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sytl3Q99N48 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sytl3Q99N48 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sytl3Q99N48 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sytl3Q99N48 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sytl3Q99N48 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sytl3Q99N48 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sytl3Q99N48 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sytl3Q99N48 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sytl3Q99N48 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sytl3Q99N48 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sytl3Q99N48 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sytl3Q99N48 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sytl3Q99N48 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sytl3Q99N48 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sytl3Q99N48 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sytl3Q99N48 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sytl3Q99N48 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sytl3Q99N48 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms