Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Apoa5Q8C7G5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Apoa5Q8C7G5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Apoa5Q8C7G5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Apoa5Q8C7G5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Apoa5Q8C7G5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Apoa5Q8C7G5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Apoa5Q8C7G5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Apoa5Q8C7G5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Apoa5Q8C7G5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Apoa5Q8C7G5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Apoa5Q8C7G5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Apoa5Q8C7G5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Apoa5Q8C7G5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Apoa5Q8C7G5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Apoa5Q8C7G5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Apoa5Q8C7G5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Apoa5Q8C7G5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Apoa5Q8C7G5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Apoa5Q8C7G5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Apoa5Q8C7G5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Apoa5Q8C7G5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Apoa5Q8C7G5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Apoa5Q8C7G5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Apoa5Q8C7G5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Apoa5Q8C7G5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apoa5Q8C7G5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apoa5Q8C7G5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Apoa5Q8C7G5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Apoa5Q8C7G5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Apoa5Q8C7G5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Apoa5Q8C7G5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Apoa5Q8C7G5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Apoa5Q8C7G5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Apoa5Q8C7G5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Apoa5Q8C7G5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Apoa5Q8C7G5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Apoa5Q8C7G5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Apoa5Q8C7G5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Apoa5Q8C7G5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apoa5Q8C7G5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apoa5Q8C7G5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Apoa5Q8C7G5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Apoa5Q8C7G5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Apoa5Q8C7G5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apoa5Q8C7G5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apoa5Q8C7G5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apoa5Q8C7G5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apoa5Q8C7G5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Apoa5Q8C7G5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apoa5Q8C7G5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apoa5Q8C7G5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Apoa5Q8C7G5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Apoa5Q8C7G5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apoa5Q8C7G5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apoa5Q8C7G5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apoa5Q8C7G5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Apoa5Q8C7G5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Apoa5Q8C7G5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Apoa5Q8C7G5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Apoa5Q8C7G5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Apoa5Q8C7G5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Apoa5Q8C7G5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Apoa5Q8C7G5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Apoa5Q8C7G5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apoa5Q8C7G5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Apoa5Q8C7G5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Apoa5Q8C7G5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apoa5Q8C7G5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Apoa5Q8C7G5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apoa5Q8C7G5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Apoa5Q8C7G5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apoa5Q8C7G5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Apoa5Q8C7G5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Apoa5Q8C7G5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Apoa5Q8C7G5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Apoa5Q8C7G5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Apoa5Q8C7G5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Apoa5Q8C7G5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apoa5Q8C7G5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apoa5Q8C7G5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apoa5Q8C7G5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Apoa5Q8C7G5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apoa5Q8C7G5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Apoa5Q8C7G5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apoa5Q8C7G5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Apoa5Q8C7G5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apoa5Q8C7G5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apoa5Q8C7G5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apoa5Q8C7G5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Apoa5Q8C7G5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Apoa5Q8C7G5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apoa5Q8C7G5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apoa5Q8C7G5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Apoa5Q8C7G5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Apoa5Q8C7G5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Apoa5Q8C7G5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apoa5Q8C7G5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apoa5Q8C7G5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apoa5Q8C7G5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms