Protein–RNA interactions for Protein: Q9D264

9230104L09Rik, Cystatin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230104L09RikQ9D264 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
9230104L09RikQ9D264 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
9230104L09RikQ9D264 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
9230104L09RikQ9D264 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
9230104L09RikQ9D264 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,68■■■□□ 2,02
9230104L09RikQ9D264 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
9230104L09RikQ9D264 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
9230104L09RikQ9D264 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
9230104L09RikQ9D264 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
9230104L09RikQ9D264 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
9230104L09RikQ9D264 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
9230104L09RikQ9D264 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
9230104L09RikQ9D264 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
9230104L09RikQ9D264 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
9230104L09RikQ9D264 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,09■■□□□ 1,77
9230104L09RikQ9D264 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
9230104L09RikQ9D264 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
9230104L09RikQ9D264 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,99■■□□□ 1,75
9230104L09RikQ9D264 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
9230104L09RikQ9D264 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
9230104L09RikQ9D264 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
9230104L09RikQ9D264 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
9230104L09RikQ9D264 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,61■■□□□ 1,69
9230104L09RikQ9D264 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
9230104L09RikQ9D264 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,55■■□□□ 1,68
9230104L09RikQ9D264 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
9230104L09RikQ9D264 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
9230104L09RikQ9D264 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
9230104L09RikQ9D264 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,24■■□□□ 1,63
9230104L09RikQ9D264 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
9230104L09RikQ9D264 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
9230104L09RikQ9D264 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
9230104L09RikQ9D264 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,19■■□□□ 1,62
9230104L09RikQ9D264 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
9230104L09RikQ9D264 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
9230104L09RikQ9D264 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25■■□□□ 1,59
9230104L09RikQ9D264 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
9230104L09RikQ9D264 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
9230104L09RikQ9D264 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
9230104L09RikQ9D264 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
9230104L09RikQ9D264 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
9230104L09RikQ9D264 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,87■■□□□ 1,57
9230104L09RikQ9D264 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
9230104L09RikQ9D264 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
9230104L09RikQ9D264 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
9230104L09RikQ9D264 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,77■■□□□ 1,56
9230104L09RikQ9D264 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
9230104L09RikQ9D264 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
9230104L09RikQ9D264 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
9230104L09RikQ9D264 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
9230104L09RikQ9D264 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
9230104L09RikQ9D264 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,51■■□□□ 1,51
9230104L09RikQ9D264 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
9230104L09RikQ9D264 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
9230104L09RikQ9D264 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
9230104L09RikQ9D264 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,45■■□□□ 1,5
9230104L09RikQ9D264 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
9230104L09RikQ9D264 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
9230104L09RikQ9D264 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
9230104L09RikQ9D264 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
9230104L09RikQ9D264 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
9230104L09RikQ9D264 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,2■■□□□ 1,46
9230104L09RikQ9D264 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,17■■□□□ 1,46
9230104L09RikQ9D264 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
9230104L09RikQ9D264 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
9230104L09RikQ9D264 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
9230104L09RikQ9D264 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,12■■□□□ 1,45
9230104L09RikQ9D264 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
9230104L09RikQ9D264 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
9230104L09RikQ9D264 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
9230104L09RikQ9D264 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
9230104L09RikQ9D264 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
9230104L09RikQ9D264 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
9230104L09RikQ9D264 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
9230104L09RikQ9D264 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
9230104L09RikQ9D264 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,89■■□□□ 1,41
9230104L09RikQ9D264 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
9230104L09RikQ9D264 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
9230104L09RikQ9D264 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
9230104L09RikQ9D264 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,8■■□□□ 1,4
9230104L09RikQ9D264 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
9230104L09RikQ9D264 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
9230104L09RikQ9D264 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
9230104L09RikQ9D264 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,75■■□□□ 1,39
9230104L09RikQ9D264 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
9230104L09RikQ9D264 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
9230104L09RikQ9D264 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
9230104L09RikQ9D264 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,7■■□□□ 1,38
9230104L09RikQ9D264 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,63■■□□□ 1,37
9230104L09RikQ9D264 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,6■■□□□ 1,37
9230104L09RikQ9D264 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
9230104L09RikQ9D264 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
9230104L09RikQ9D264 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,55■■□□□ 1,36
9230104L09RikQ9D264 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
9230104L09RikQ9D264 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,51■■□□□ 1,35
9230104L09RikQ9D264 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
9230104L09RikQ9D264 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
9230104L09RikQ9D264 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
9230104L09RikQ9D264 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
9230104L09RikQ9D264 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32,6 ms