RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	GIS3	Q12418	502 aa		11.72	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	CKI1	P20485	582 aa		11.71	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	STE11	P23561	717 aa		11.71	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	YGR021W	P53212	290 aa		11.71	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	SOV1	Q04748	898 aa		11.71	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	RGA2	Q06407	1009 aa		11.71	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	YOR131C	Q12486	218 aa		11.71	□□□□□ -0.53
DDR2	YOL052C-A	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	TCD1	P38756	429 aa		11.7	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	VPS70	P47161	811 aa		11.7	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	TBF1	Q02457	562 aa		11.7	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	MCM16	Q12262	181 aa		11.7	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	YEL043W	P32618	956 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	BUD2	P33314	1104 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	DUR3	P33413	735 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	KIC1	P38692	1080 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	AFG3	P39925	761 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	BUD16	P39988	312 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	CPR7	P47103	393 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	ULP1	Q02724	621 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	NGL3	Q03210	505 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	SHS1	Q07657	551 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	CDC42	P19073	191 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	IME1	P21190	360 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	SCJ1	P25303	377 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	DPB3	P27344	201 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	CSG2	P35206	410 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	ISM1	P48526	1002 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	PPM1	Q04081	328 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	PSY2	P40164	858 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	CLA4	P48562	842 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	TPO2	P53283	614 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	BTN2	P53286	410 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	MAL13	P53338	473 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	SIL1	Q08199	421 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	ZPS1	Q12512	249 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	LAA1	P39526	2014 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	ASP3-2	P0CX77	362 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	ASP3-3	P0CX78	362 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	ASP3-4	P0CX79	362 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	TRM2	P33753	639 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	BLI1	P35727	113 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	YAP1801	P38856	637 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	SAD1	P43589	448 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	SGM1	P47166	707 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	YMR018W	Q04364	514 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	SFI1	Q12369	946 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	DAL2	P25335	343 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	CDC11	P32458	415 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	PAH1	P32567	862 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	YKL050C	P35736	922 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	BYE1	P36106	594 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	EXO5	P38289	585 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	YTA12	P40341	825 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	AZR1	P50080	613 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	VPS62	P53285	467 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	YLR001C	Q07895	862 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDR2	YOL052C-A	COX4	P04037	155 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	GLN3	P18494	730 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	CBF2	P32504	956 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	KAP114	P53067	1004 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	MUK1	Q02866	612 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	MAM3	Q12296	706 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	ERG11	P10614	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	PRR1	P28708	518 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	DYS1	P38791	387 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	SPC72	P39723	622 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	LAM5	P43560	674 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	ULI1	P43604	169 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	YGR130C	P53278	816 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDR2	YOL052C-A	JJJ1	P53863	590 aa		11.63	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.7 ms