RNA–Protein interactions for RNA: YMR033W

ARP9, Transcript of Component of both the SWI/SNF and RSC chromatin remodeling complexes, yeast

Gene ARP9, Length 1,404 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ARP9	YMR033W	SED4	P25365	1065 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	TOM20	P35180	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	CTF8	P38877	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	SDP1	P40479	209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	YFL052W	P43551	465 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	HFD1	Q04458	532 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	HMI1	Q12039	706 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	UPC2	Q12151	913 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	EMC1	P25574	760 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	SEG2	P34250	1132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	CKB2	P38930	258 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	CHA4	P43634	648 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	YJR096W	P47137	282 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	SPT20	P50875	604 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	ZIP2	P53061	704 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	GPG1	P53130	126 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	VPS62	P53285	467 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ARP9	YMR033W	CDC6	P09119	513 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	MIH1	P23748	554 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	YHR078W	P38799	552 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	SSY5	P47002	699 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	BNA2	P47125	453 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	CDC20	P26309	610 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	YAP6	Q03935	383 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	STE14	P32584	239 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	YKR051W	P36142	418 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	FLR1	P38124	548 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	PZF1	P39933	429 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	NCS6	P53088	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	TMA17	Q12513	150 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	SOD2	P00447	233 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	MRC1	P25588	1096 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	PAF1	P38351	445 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	SAK1	P38990	1142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	RIM8	P53179	542 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	PLB1	P39105	664 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	CDA2	Q06703	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	SWM1	Q12379	170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	NPC2	Q12408	173 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	YKR018C	P36114	725 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	TDA3	P38758	523 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	NIT1	P40447	199 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	VHR1	P40522	640 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	RET2	P43621	546 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	YGR153W	P48238	217 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	FOL1	P53848	824 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	EUG1	P32474	517 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	NGG1	P32494	702 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	MSS4	P38994	779 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	IRC24	P40580	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	ASI2	P53895	289 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	ORC4	P54791	529 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARP9	YMR033W	TOD6	P34219	525 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARP9	YMR033W	MNN4	P36044	1178 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARP9	YMR033W	PFA3	P42836	336 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARP9	YMR033W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ARP9	YMR033W	BFA1	P47113	574 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARP9	YMR033W	YJR120W	P47157	116 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARP9	YMR033W	PCL10	P53124	433 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARP9	YMR033W	PKH1	Q03407	766 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARP9	YMR033W	PEX19	Q07418	342 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARP9	YMR033W	TRE2	Q08693	809 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARP9	YMR033W	MAL31	P38156	614 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ARP9	YMR033W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ARP9	YMR033W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ARP9	YMR033W	AVT1	P47082	602 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ARP9	YMR033W	YBP2	P53169	641 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ARP9	YMR033W	ASM4	Q05166	528 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ARP9	YMR033W	YLR358C	O13565	187 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ARP9	YMR033W	YLR415C	O13578	112 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ARP9	YMR033W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ARP9	YMR033W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.5	□□□□□ -1.69	not detected

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