RNA–Protein interactions for RNA: YML014W

TRM9, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM9, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM9	YML014W	TPO2	P53283	614 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRM9	YML014W	SHS1	Q07657	551 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TRM9	YML014W	SRB4	P32569	687 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TRM9	YML014W	UIP5	P36137	443 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TRM9	YML014W	EFM4	P40516	257 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TRM9	YML014W	SAD1	P43589	448 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TRM9	YML014W	ISM1	P48526	1002 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TRM9	YML014W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TRM9	YML014W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TRM9	YML014W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TRM9	YML014W	PET123	P17558	318 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TRM9	YML014W	VPS72	Q03388	795 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TRM9	YML014W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	TRM2	P33753	639 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	KIC1	P38692	1080 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	YAP1801	P38856	637 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	SEC9	P40357	651 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	MUK1	Q02866	612 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	ZPS1	Q12512	249 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	HXT1	P32465	570 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	CPR7	P47103	393 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	VPS70	P47161	811 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	YGR021W	P53212	290 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	VPS60	Q03390	229 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	VAC14	Q06708	880 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	GLN3	P18494	730 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	CDC42	P19073	191 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	IME1	P21190	360 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	RAD57	P25301	460 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	LAM5	P43560	674 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	SML1	Q04964	104 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	PCD1	Q12524	340 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	MOT1	P32333	1867 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	PET111	P08468	800 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	CKI1	P20485	582 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	CBF2	P32504	956 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	CSG2	P35206	410 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	NDC80	P40460	691 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	CLA4	P48562	842 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	SOV1	Q04748	898 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	COX4	P04037	155 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	SCJ1	P25303	377 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	FUB1	P25659	250 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	PRR1	P28708	518 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	TCD1	P38756	429 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	YGR130C	P53278	816 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	BOP3	P53958	396 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	FMP30	Q02883	468 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	PPM1	Q04081	328 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	DAL2	P25335	343 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	PSY2	P40164	858 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	CEP3	P40969	608 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	ULI1	P43604	169 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TRM9	YML014W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	SDH2	P21801	266 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	DRE2	P36152	348 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	EXO5	P38289	585 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	TVP23	P38962	199 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	ALT2	P52892	507 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	RIF1	P29539	1916 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	CDC11	P32458	415 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	BLI1	P35727	113 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	YKL050C	P35736	922 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	YHR054C	P38780	354 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	YTA12	P40341	825 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	SGM1	P47166	707 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	GCV2	P49095	1034 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	BTN2	P53286	410 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	NGL3	Q03210	505 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	YMR018W	Q04364	514 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	MCM16	Q12262	181 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TRM9	YML014W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25

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