RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIR3	YKL163W	MDL2	P33311	773 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	PEX6	P33760	1030 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	MRP8	P35719	219 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	YKL069W	P36088	180 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	YAP1801	P38856	637 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	IRR1	P40541	1150 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	EST2	Q06163	884 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	PSR2	Q07949	397 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	YRF1-6	P53819	1859 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	SPE2	P21182	396 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	NFU1	P32860	256 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	HOS4	P40480	1083 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	YJR120W	P47157	116 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	UME1	Q03010	460 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	SHE9	Q04172	456 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	THI73	Q07904	523 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	RRI2	Q12348	645 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	AGP1	P25376	633 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	YSC84	P32793	468 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	DUT1	P33317	147 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	MAL31	P38156	614 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	RIM4	P38741	713 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	RRT14	P40470	206 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	SRB7	P47822	140 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	PEX14	P53112	341 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	YNL193W	P53870	558 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	KIN4	Q01919	800 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	RKM2	Q03942	479 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	ESC2	Q06340	456 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	FMP25	Q08023	583 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	TRE2	Q08693	809 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	SNF2	P22082	1703 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	MHP1	P43638	1398 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	FOB1	O13329	566 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	KIP1	P28742	1111 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	SWI3	P32591	825 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	TOD6	P34219	525 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	YBR071W	P38243	211 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	GPB2	P39717	880 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	VPS53	P47061	822 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	PIP2	P52960	996 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	RIM8	P53179	542 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	MEH1	Q02205	184 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	SPC19	Q03954	165 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PIR3	YKL163W	GCR1	P07261	785 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	STE5	P32917	917 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	PBY1	P38254	753 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	SPC105	P53148	917 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	HFD1	Q04458	532 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	RSC58	Q07979	502 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	PTC5	Q12511	572 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	PIF1	P07271	859 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	ERT1	P38140	529 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	APC1	P53886	1748 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	COG6	P53959	839 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	MRL1	Q06815	381 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	MPD2	Q99316	277 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	SIR4	P11978	1358 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	SOD2	P00447	233 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	SPS1	P08458	490 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	PTP2	P29461	750 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	EUG1	P32474	517 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	VBA5	P36172	582 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	ALG3	P38179	458 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	SNO2	P53823	222 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	MET14	Q02196	202 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	ROD1	Q02805	837 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	HDA2	Q06629	674 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PIR3	YKL163W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65

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