RNA–Protein interactions for RNA: YKL111C

YKL111C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL111C, Length 336 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL111CYKL111C PEX6P33760 1030 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C DEF1P35732 738 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C NMD2P38798 1089 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C CAF16P43569 289 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C ASM4Q05166 528 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C YLR001CQ07895 862 aa3.33□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C MET6P05694 767 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C VBA3P25594 458 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C CTF13P35203 478 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C YKL222CP35995 705 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C SET5P38890 526 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C RLP7P40693 322 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C ZIP2P53061 704 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C MRPS35P53292 345 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C TRM13Q12383 476 aa3.32□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C PRC1P00729 532 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C TRP4P07285 380 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C SRD1P09007 221 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C PFK1P16861 987 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C STO1P34160 861 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C SSY5P47002 699 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C SLI1P53304 468 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C POB3Q04636 552 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C PEX19Q07418 342 aa3.31□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C DIF1O13577 133 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C PCL2P25693 308 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C PMI40P29952 429 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C PPG1P32838 368 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C SAK1P38990 1142 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C DSS1P39112 969 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C VHR1P40522 640 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C PFA3P42836 336 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C ALY2P47029 1046 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C ZDS1P50111 915 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C PUS2P53167 370 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C KIN4Q01919 800 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C YLR149CQ99296 730 aa3.3□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C YLR415CO13578 112 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C RPL8AP17076 256 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C GSY1P23337 708 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C TRM2P33753 639 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C SAP190P36123 1033 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C CHS7P38843 316 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C BNA2P47125 453 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C SUN4P53616 420 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C DNM1P54861 757 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C PUS9Q12069 462 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C SWM1Q12379 170 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C TRM11Q12463 433 aa3.29□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C NOP14Q99207 810 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C RAD18P10862 487 aa3.28□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C CAD1P24813 409 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C HRR25P29295 494 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C EFT1P32324 842 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C HOG1P32485 435 aa3.28□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C YEL1P34225 687 aa3.28□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C PCM1P38628 557 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C RPP1P38786 293 aa3.28□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C MNN1P39106 762 aa3.28□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C YNL193WP53870 558 aa3.28□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C TFB2Q02939 513 aa3.28□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C ATG33Q06485 197 aa3.28□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C YLR040CQ07988 224 aa3.28□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C Q0142Q9ZZW4 58 aa3.28□□□□□ -1.88
YKL111CYKL111C HMG1P12683 1054 aa3.27□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C ERG4P25340 473 aa3.27□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C YKR051WP36142 418 aa3.27□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C SIC1P38634 284 aa3.27□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C PZF1P39933 429 aa3.27□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C SHR5P41912 237 aa3.27□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C MET13P53128 600 aa3.27□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C CRR1Q05790 422 aa3.27□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C TUB2P02557 457 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C SFL1P20134 766 aa3.26□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C YBR053CP38235 358 aa3.26□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C MIP6P38760 659 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C MGS1P40151 587 aa3.26□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C FKH2P41813 862 aa3.26□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C MSE1P48525 536 aa3.26□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C DOS2P54858 310 aa3.26□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C ARP4P80428 489 aa3.26□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C NHX1Q04121 633 aa3.26□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C COG8Q04632 607 aa3.26□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C GSF2Q04697 403 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C TGL5Q12043 749 aa3.26□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C CCR4P31384 837 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C SPC42P36094 363 aa3.25□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C YKR018CP36114 725 aa3.25□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C KTR4P38131 464 aa3.25□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C HSL7P38274 827 aa3.25□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C RPN10P38886 268 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C AIM21P40563 679 aa3.25□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C UBC9P50623 157 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C AIM14P53109 570 aa3.25□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C LEE1Q02799 301 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C PKH1Q03407 766 aa3.25□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C AIM39Q08223 395 aa3.25□□□□□ -1.89
YKL111CYKL111C ADE2P21264 571 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.4 ms