RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE4	YKL049C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	GSY1	P23337	708 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	MSH2	P25847	964 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	SSY5	P47002	699 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	HXT16	P47185	567 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	AIM39	Q08223	395 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	TRM11	Q12463	433 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	MEF1	P25039	761 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	PPG1	P32838	368 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	MTC2	P34246	357 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	SAK1	P38990	1142 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	PZF1	P39933	429 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	VHR1	P40522	640 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	BUL1	P48524	976 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	MSE1	P48525	536 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	ASI2	P53895	289 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	UGO1	Q03327	502 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	THI21	Q08975	551 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	CDC9	P04819	755 aa		4	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	NGG1	P32494	702 aa		4	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	CTF13	P35203	478 aa		4	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	AIM21	P40563	679 aa		4	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	RNH70	P53331	553 aa		4	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	ALG12	P53730	551 aa		4	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	PKH1	Q03407	766 aa		4	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	CRR1	Q05790	422 aa		4	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	PUS9	Q12069	462 aa		4	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	VBA3	P25594	458 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	PEX6	P33760	1030 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	MCD4	P36051	919 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	RPP1	P38786	293 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	ZIP2	P53061	704 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	SUN4	P53616	420 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	ERG5	P54781	538 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	KIN4	Q01919	800 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	NTG2	Q08214	380 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	SRD1	P09007	221 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	KTR4	P38131	464 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	PFA3	P42836	336 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	CAF16	P43569	289 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	YDR338C	Q05497	695 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	YLR415C	O13578	112 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	MET3	P08536	511 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	ERG4	P25340	473 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	YLR040C	Q07988	224 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	PNS1	Q12412	539 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CSE4	YKL049C	RAD18	P10862	487 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	SUL1	P38359	859 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	FKH2	P41813	862 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	YFL052W	P43551	465 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	MRPS35	P53292	345 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	NRG1	Q03125	231 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	GPR1	Q12361	961 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	HOG1	P32485	435 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	SIC1	P38634	284 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	ELO3	P40319	345 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	BNA2	P47125	453 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	NPY1	P53164	384 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	RNT1	Q02555	471 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	DLT1	Q04216	342 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	ASM4	Q05166	528 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	YOL073C	Q08232	322 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	TRM13	Q12383	476 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	CHS7	P38843	316 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	TFB2	Q02939	513 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	NHX1	Q04121	633 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	YLR149C	Q99296	730 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	ALG7	P07286	448 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	YEL1	P34225	687 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	YKR051W	P36142	418 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	HSL7	P38274	827 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	YBR259W	P38338	688 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	MNN1	P39106	762 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	MUP1	P50276	574 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	YBP2	P53169	641 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	SLI1	P53304	468 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	TGL5	Q12043	749 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	MIH1	P23748	554 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	PCL2	P25693	308 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
CSE4	YKL049C	AMA1	P50082	593 aa		3.92	□□□□□ -1.78

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