RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	MTMR3	Q13615	1198 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	IFT43	Q96FT9	208 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	STIM2	Q9P246	746 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		7.05	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	TLDC2	A0PJX2	215 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM26D	Q5JW98	314 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		7.04	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	CDC14C	A4D256	554 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	IER5	Q5VY09	327 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	SV2A	Q7L0J3	742 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	7.03	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		7.03	□□□□□ -1.28
EFHC1-223	ENST00000636616		H3BM21	787 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	NPR3	P17342	541 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		7.02	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	ZBTB39	O15060	712 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	MICAL2	O94851	1124 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	MPST	P25325	297 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	TREML1	Q86YW5	311 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	ABTB2	Q8N961	1025 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	GPATCH3	Q96I76	525 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR62	O43379	1518 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB11FIP3	O75154	756 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM13A	O94988	1023 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	GSK3A	P49840	483 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	CEP63	Q96MT8	703 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	PIF1	Q9H611	641 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	TBX22	Q9Y458	520 aa		7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	7.01	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	BNIP3L	O60238	219 aa		7	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHA1	P01876	353 aa		7	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM157B	P0CG42	384 aa		7	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP2B1	P20020	1258 aa		7	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	7	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	IDH3A	P50213	366 aa		7	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	FANCC	Q00597	558 aa		7	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	TNP2	Q05952	138 aa		7	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	TYRO3	Q06418	890 aa		7	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	SDE2	Q6IQ49	451 aa		7	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		7	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	TMC7	Q7Z402	723 aa		7	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		7	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM161B	Q96MY7	647 aa		7	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		7	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	TOPBP1	Q92547	1522 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	CUX2	O14529	1486 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR25	O00155	361 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	OPLAH	O14841	1288 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	GDF11	O95390	407 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	INPP5B	P32019	993 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	CAPN10	Q9HC96	672 aa		6.99	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	EFS	O43281	561 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	VSIG8	P0DPA2	414 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	GMPR	P36959	345 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	ZAP70	P43403	619 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	ARMC5	Q96C12	935 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	BRD7	Q9NPI1	651 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF19A	Q9NV58	838 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	TOP2B	Q02880	1626 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	ARSD	P51689	593 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	6.98	□□□□□ -1.29
EFHC1-223	ENST00000636616	ATCAY	Q86WG3	371 aa		6.98	□□□□□ -1.29

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