RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506437.1

ITGA3-208, Transcript of integrin subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene ITGA3, Length 3,055 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITGA3-208	ENST00000506437	FAM161A	Q3B820	660 aa		14	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	ILDR2	Q71H61	639 aa		14	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	NUP98	P52948	1817 aa		14	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		14	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	ALDH1L1	O75891	902 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	LY75	O60449	1722 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	C4B	P0C0L5	1744 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	PLSCR1	O15162	318 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	MRE11	P49959	708 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		13.99	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	ERFE	Q4G0M1	354 aa		13.98	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	UQCRH	P07919	91 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	NARF	Q9UHQ1	456 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	CASP7	P55210	303 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		13.97	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	BAG6	P46379	1132 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	ATP8B2	P98198	1209 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437		H7C1W4	665 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	GYS1	P13807	737 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	NFIX	Q14938	502 aa		13.96	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
ITGA3-208	ENST00000506437	CBX1	P83916	185 aa		13.96	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	FOXO4	P98177	505 aa		13.96	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	SETDB2	Q96T68	719 aa		13.96	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		13.96	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	SNAP23	O00161	211 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	OFD1	O75665	1012 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	GREM2	Q9H772	168 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	TRAK2	O60296	914 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	SEC24B	O95487	1268 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		13.95	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	AKT1S1	Q96B36	256 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	MAP7D2	Q96T17	732 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	TAF1	P21675	1872 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	LRRC24	Q50LG9	513 aa		13.94	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	NTSR2	O95665	410 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	MCM4	P33991	863 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	SLC15A2	Q16348	729 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.93	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	ZBTB7A	O95365	584 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	ABCC12	Q96J65	1359 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	DDR1	Q08345	913 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	TSC1	Q92574	1164 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	DCTPP1	Q9H773	170 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	13.92	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	HMMR	O75330	724 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	SSH3	Q8TE77	659 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	ZBTB9	Q96C00	473 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	UTY	O14607	1347 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	C4A	P0C0L4	1744 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	MMP10	P09238	476 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	ITGA6	P23229	1130 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	STK32B	Q9NY57	414 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ITGA3-208	ENST00000506437	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.9	□□□□□ -0.18

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