RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 PAF1Q8N7H5 531 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-201ENST00000418331 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-201ENST00000418331 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-201ENST00000418331 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-201ENST00000418331 ZBTB43O43298 467 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-201ENST00000418331 DDB1Q16531 1140 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-201ENST00000418331 SNX21Q969T3 373 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-201ENST00000418331 KIF18AQ8NI77 898 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-201ENST00000418331 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-201ENST00000418331 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-201ENST00000418331 SETDB2Q96T68 719 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-201ENST00000418331 KIF20AO95235 890 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC102BQ68D86 513 aa24.71■■□□□ 1.55
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PTPRJ-201ENST00000418331 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.71■■□□□ 1.55
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PTPRJ-201ENST00000418331 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.7■■□□□ 1.55
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PTPRJ-201ENST00000418331 STX8Q9UNK0 236 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 KIF5CO60282 957 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 NEFHP12036 1026 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 ST5P78524 1137 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 TSPYL1Q9H0U9 437 aa24.7■■□□□ 1.54
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PTPRJ-201ENST00000418331 CALML4Q96GE6 196 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 CAVIN2O95810 425 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
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PTPRJ-201ENST00000418331 CENPHQ9H3R5 247 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 Q6ZUG5 572 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 NEMFO60524 1076 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 SIRT1Q96EB6 747 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
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PTPRJ-201ENST00000418331 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 IDEP14735 1019 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 KANK3Q6NY19 840 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
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PTPRJ-201ENST00000418331 TOM1O60784 492 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 TMC6Q7Z403 805 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
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PTPRJ-201ENST00000418331 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.66■■□□□ 1.54
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PTPRJ-201ENST00000418331 PDCL2Q8N4E4 241 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 ISM2Q6H9L7 571 aa24.66■■□□□ 1.54
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PTPRJ-201ENST00000418331 POTEJP0CG39 1038 aa24.65■■□□□ 1.54
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PTPRJ-201ENST00000418331 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
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PTPRJ-201ENST00000418331 SYKP43405 635 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC102AQ96A19 550 aa24.64■■□□□ 1.54
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PTPRJ-201ENST00000418331 G2E3Q7L622 706 aa24.64■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 TNNT1P13805 278 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 CASQ1P31415 396 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 USP48Q86UV5 1035 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 TSPY3P0CV98 308 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 TSPY8P0CW00 308 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNG4Q8TDN1 519 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
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