RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 PANK2Q9BZ23 570 aa20.22■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.22■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.22■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.22■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 STK3Q13188 491 aa20.21■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 SLC27A2O14975 620 aa20.21■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 KCNQ4P56696 695 aa20.21■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.21■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.21■□□□□ 0.83
PKN3-201ENST00000291906 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.2■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.2■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 ADORA1P30542 326 aa20.2■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 ATP6V1AP38606 617 aa20.2■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 CUL4AQ13619 759 aa20.2■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 NECTIN1Q15223 517 aa20.2■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.2■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.19■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 RNF20Q5VTR2 975 aa20.19■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 MAP4K1Q92918 833 aa20.19■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 FGD1P98174 961 aa20.19■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.19■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.19■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.828e-6■■■□□ 17.3
PKN3-201ENST00000291906 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.18■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.18■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 METTL24Q5JXM2 366 aa20.18■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.18■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 TTC14Q96N46 770 aa20.18■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 HAUS7Q99871 368 aa20.18■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.18■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 GREM2Q9H772 168 aa20.18■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 NLRP10Q86W26 655 aa20.17■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.17■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 C8orf37Q96NL8 207 aa20.17■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 TAF5LO75529 589 aa20.17■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 WASHC4Q2M389 1173 aa20.17■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 ABCA3Q99758 1704 aa20.17■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.17■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 ITGA6P23229 1130 aa20.16■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 PI16Q6UXB8 463 aa20.16■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.16■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 TNS2Q63HR2 1409 aa20.16■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 KCNQ2O43526 872 aa20.16■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.16■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 PTMSP20962 102 aa20.15■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.15■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.15■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.15■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 XAGE2Q96GT9 111 aa20.15■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 VPS53Q5VIR6 699 aa20.15■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 NGLY1Q96IV0 654 aa20.15■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa20.15■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 GLI3P10071 1580 aa20.14■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.14■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 PSMA5P28066 241 aa20.14■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 SMIM5Q71RC9 77 aa20.14■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
PKN3-201ENST00000291906 BRD1O95696 1058 aa20.14■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 ME3Q16798 604 aa20.14■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 BCL9O00512 1426 aa20.14■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 GJB2P29033 226 aa20.14■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 FAM182BQ5T319 152 aa20.13■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.13■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.13■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 PPFIA3O75145 1194 aa20.13■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.13■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 TPCN1Q9ULQ1 816 aa20.13■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.12■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.12■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 ZNF609O15014 1411 aa20.12■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.12■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 SNAP23O00161 211 aa20.12■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.12■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.12■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 SCARF1Q14162 830 aa20.12■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.12■□□□□ 0.81
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