RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229022.7

VDR-201, Transcript of vitamin D receptor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VDR, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDR-201ENST00000229022 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.01□□□□□ -0.01
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VDR-201ENST00000229022 TAF3Q5VWG9 929 aa15□□□□□ -0.01
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VDR-201ENST00000229022 WDR62O43379 1518 aa15□□□□□ -0.01
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VDR-201ENST00000229022 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
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VDR-201ENST00000229022 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.96□□□□□ -0.01
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VDR-201ENST00000229022 ATL3Q6DD88 541 aa14.96□□□□□ -0.01
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VDR-201ENST00000229022 Q6ZUG5 572 aa14.94□□□□□ -0.02
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VDR-201ENST00000229022 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
VDR-201ENST00000229022 ADGRL2O95490 1459 aa14.94□□□□□ -0.02
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VDR-201ENST00000229022 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
VDR-201ENST00000229022 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa14.94□□□□□ -0.02
VDR-201ENST00000229022 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
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