RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa17.9■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Chmp4cQ9D7F7 232 aa17.9■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rps6kb1Q8BSK8 525 aa17.9■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Usp44Q8C2S0 711 aa17.9■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cfap44E9Q5M6 1843 aa17.9■□□□□ 0.46
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AppP12023 770 aa17.89■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa17.89■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem266Q8BZB3 538 aa17.89■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa17.89■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc4a1P04919 929 aa17.89■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rnf20Q5DTM8 973 aa17.89■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kif20aP97329 887 aa17.88■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PogkQ80TC5 607 aa17.88■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Polr3dQ91WD1 398 aa17.88■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cacna1sQ02789 1880 aa17.88■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cyp2d10P24456 504 aa17.88■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Wdr93Q402B2 695 aa17.88■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rdm1Q9CQK3 281 aa17.88■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gadd45bP22339 160 aa17.87■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pde4dQ01063 747 aa17.87■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gsdma2Q32M21 443 aa17.87■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa17.87■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NpeppsQ11011 920 aa17.87■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc129Q14B48 1034 aa17.87■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stx6Q9JKK1 255 aa17.87■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Plch1Q4KWH5 1682 aa17.87■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Timm10P62073 90 aa17.87■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cpa2Q504N0 417 aa17.87■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Aox1O54754 1333 aa17.86■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 DpydQ8CHR6 1025 aa17.86■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Krt25Q8VCW2 446 aa17.86■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MecomP14404 1042 aa17.86■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kank4Q6P9J5 1016 aa17.86■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4931400O07RikQ9D4M5 137 aa17.86■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Erc1Q99MI1 1120 aa17.85■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atp8a2P98200 1148 aa17.85■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tbc1d30Q69ZT9 766 aa17.85■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ankrd23Q812A3 306 aa17.85■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Jmjd4Q8BFT6 427 aa17.84■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 F2rP30558 430 aa17.84■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tubb6Q922F4 447 aa17.84■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vps33bP59016 617 aa17.83■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Znf692Q3U381 531 aa17.83■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ttc19Q8CC21 365 aa17.83■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Foxo4Q9WVH3 505 aa17.83■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Col3a1P08121 1464 aa17.83■□□□□ 0.45
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Exoc5Q3TPX4 708 aa17.83■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kcnq5Q9JK45 933 aa17.83■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ftl2P49945 183 aa17.83■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zbtb1Q91VL9 713 aa17.83■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lrrfip2Q91WK0 415 aa17.83■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa17.82■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 FanccP50652 591 aa17.82■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Scn11aQ9R053 1765 aa17.82■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adam1aQ60813 791 aa17.82■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Golim4Q8BXA1 655 aa17.82■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppp4r3bQ922R5 820 aa17.82■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp113Q8C689 439 aa17.82■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pus3Q9JI38 481 aa17.82■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa17.81■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 C4bP01029 1738 aa17.81■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 FAM186AQ9D9R9 1790 aa17.8■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 TsksO54887 585 aa17.8■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zbtb38Q3LR78 1197 aa17.8■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Il17raQ60943 864 aa17.8■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa17.8■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gpr182P43142 395 aa17.8■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fbxo3Q9DC63 480 aa17.8■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Exosc10P56960 887 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pm20d1Q8C165 503 aa17.79■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 TnksQ6PFX9 1320 aa17.79■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ctdnep1Q3TP92 244 aa17.79■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cops6O88545 324 aa17.78■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Chmp3Q9CQ10 224 aa17.78■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kif4P33174 1231 aa17.78■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppp1r10Q80W00 888 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 GptQ8QZR5 496 aa17.78■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bloc1s2Q9CWG9 143 aa17.78■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa17.78■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Carmil3Q3UFQ8 1375 aa17.78■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prr5lA2AVJ5 370 aa17.77■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prr29B1ARI9 187 aa17.77■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prl7a2O54831 253 aa17.77■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Plekhf1Q3TB82 279 aa17.77■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Leo1Q5XJE5 667 aa17.77■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zkscan8Q8BSL0 588 aa17.77■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tceanc2Q8R2M0 207 aa17.77■□□□□ 0.44
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.7 ms