RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Casc1Q6TDU8 730 aa21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp113Q8C689 439 aa21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ZyxQ62523 564 aa21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem266Q8BZB3 538 aa21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 DpydQ8CHR6 1025 aa21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rdm1Q9CQK3 281 aa21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rcan3Q9JKK0 239 aa21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyb5rlB1AS42 316 aa21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Eya2O08575 532 aa21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gsdma2Q32M21 443 aa21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm12185Q5NCB2 835 aa21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Leo1Q5XJE5 667 aa21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Acsbg1Q99PU5 721 aa21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vps54Q5SPW0 977 aa21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppp1r10Q80W00 888 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Usp44Q8C2S0 711 aa21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arap2Q8BZ05 1703 aa21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nav1Q8CH77 1875 aa21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc173A0JLY1 547 aa21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kank4Q6P9J5 1016 aa21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mb21d2Q8C525 428 aa21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 F2rP30558 430 aa21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Jarid2Q62315 1234 aa21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nol12Q8BG17 217 aa21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Casz1Q9CWL2 1761 aa21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zscan22Q8BGS5 496 aa21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krt25Q8VCW2 446 aa21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 LratQ9JI60 231 aa21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Klhl34A2AI76 644 aa21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Usp48Q3V0C5 1052 aa21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zscan25B2RX31 543 aa21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Stat1P42225 749 aa21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Znf692Q3U381 531 aa21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nap1l3Q794H2 544 aa21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Asap2Q7SIG6 958 aa21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PdcQ9QW08 244 aa21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lrrfip2Q91WK0 415 aa21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Erich6bQ9D4S6 220 aa21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Irgm2A0A140LIF8 407 aa21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 E4f1Q8CCE9 783 aa21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppp4r3bQ922R5 820 aa21.5■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kcnh4A2A5F7 1018 aa21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp51Q3U4L8 781 aa21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ptcd1Q8C2E4 695 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kcnn1Q9EQR3 537 aa21.49■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lrp6O88572 1613 aa21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc66Q6NS45 935 aa21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TrdnE9Q9K5 693 aa21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Esyt1Q3U7R1 1092 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wdr24Q8CFJ9 790 aa21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rnf214Q8BFU3 668 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Samm50Q8BGH2 469 aa21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Golim4Q8BXA1 655 aa21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tceanc2Q8R2M0 207 aa21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zeb2Q9R0G7 1215 aa21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cd22P35329 862 aa21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tsr2Q8C8T8 191 aa21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chmp3Q9CQ10 224 aa21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ZwintQ9CQU5 252 aa21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ush1cQ9ES64 910 aa21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hap1O35668 628 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Timm10P62073 90 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NpeppsQ11011 920 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc129Q14B48 1034 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 R3hcc1Q8BSI6 488 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ctdnep1Q3TP92 244 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Me3Q8BMF3 604 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 BrapQ99MP8 591 aa21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wdr33Q8K4P0 1330 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atp8a2P98200 1148 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Plcd1Q8R3B1 756 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Srgap1Q91Z69 1062 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chd1lQ9CXF7 900 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cap2Q9CYT6 476 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spata31d1bE9QA57 1361 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 EappQ5BU09 281 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Clca2Q8BG22 942 aa21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Becn1O88597 448 aa21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 121.1 ms