RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa27.29■■□□□ 1.96
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smc4Q8CG47 1286 aa27.29■■□□□ 1.96
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ttc14Q9CSP9 761 aa27.29■■□□□ 1.96
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AampJ3QN89 436 aa27.28■■□□□ 1.96
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 NeflP08551 543 aa27.28■■□□□ 1.96
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tceal9Q9DD24 104 aa27.24■■□□□ 1.95
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Triml2E9PW10 424 aa27.21■■□□□ 1.95
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa27.2■■□□□ 1.94
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nrxn2E9Q7X7 1710 aa27.19■■□□□ 1.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Glt1d1A4FUP9 346 aa27.19■■□□□ 1.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Oas2E9Q9A9 742 aa27.19■■□□□ 1.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tm6sf1P58749 370 aa27.19■■□□□ 1.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc51aQ8R000 340 aa27.19■■□□□ 1.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Socs7Q8VHQ2 579 aa27.19■■□□□ 1.94
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 DaglaQ6WQJ1 1044 aa27.18■■□□□ 1.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atp8b2P98199 1209 aa27.17■■□□□ 1.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tgfb1i1Q62219 461 aa27.17■■□□□ 1.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dydc2Q9D3X8 139 aa27.17■■□□□ 1.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pappa2E9PZ87 1789 aa27.17■■□□□ 1.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eif6O55135 245 aa27.16■■□□□ 1.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prl3d2F6R3P9 224 aa27.15■■□□□ 1.94
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 VeztQ3ZK22 780 aa27.14■■□□□ 1.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Popdc2Q9ES82 367 aa27.14■■□□□ 1.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lgr5Q9Z1P4 907 aa27.14■■□□□ 1.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gdf11Q9Z1W4 405 aa27.14■■□□□ 1.94
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Thsd7bQ6P4U0 1607 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hoxd11P23813 323 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 VgfQ0VGU4 617 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Map9Q3TRR0 646 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adora1Q60612 326 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ubxn2aQ99KJ0 258 aa27.12■■□□□ 1.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tom1l2Q5SRX1 507 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Itga6Q61739 1091 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Skor1Q8BX46 964 aa27.11■■□□□ 1.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kif2cQ922S8 721 aa27.11■■□□□ 1.93
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Srgap3Q812A2 1099 aa27.1■■□□□ 1.93
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdca7Q9D0M2 382 aa27.1■■□□□ 1.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa27.1■■□□□ 1.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 HlfQ8BW74 295 aa27.09■■□□□ 1.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Naa16Q9DBB4 864 aa27.09■■□□□ 1.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Map3k15A2AQW0 1331 aa27.09■■□□□ 1.93
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vsig10D3YX43 558 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Csrnp3P59055 597 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem87bQ8BKU8 555 aa27.08■■□□□ 1.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ecm29Q6PDI5 1840 aa27.07■■□□□ 1.92
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Snrpa1P57784 255 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Calr4Q3TQS0 420 aa27.07■■□□□ 1.92
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Psmd1Q3TXS7 953 aa27.06■■□□□ 1.92
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc93Q7TQK5 629 aa27.06■■□□□ 1.92
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam13aQ8BGI4 693 aa27.06■■□□□ 1.92
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CpvlQ9D3S9 478 aa27.06■■□□□ 1.92
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Klf15Q9EPW2 415 aa27.06■■□□□ 1.92
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Best3Q6H1V1 669 aa27.05■■□□□ 1.92
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