RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 NPIPB7O75200 414 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ASAH2BP0C7U1 165 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 GP1BBP13224 206 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PRKCAP17252 672 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CHAF1BQ13112 559 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 IGFN1Q86VF2 1251 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 NTNG2Q96CW9 530 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 HCAR1Q9BXC0 346 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 METTL7AQ9H8H3 244 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PROK2Q9HC23 129 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SH2D2AQ9NP31 389 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF337Q9Y3M9 751 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PRODHO43272 600 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP1R3DO95685 299 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 HMGN1P05114 100 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 GRK5P34947 590 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC9A3P48764 834 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 GABREP78334 506 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR107Q5VW38 600 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 H3F3CQ6NXT2 135 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ASCL5Q7RTU5 278 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 GRINAQ7Z429 371 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TMPRSS12Q86WS5 348 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 STX19Q8N4C7 294 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 WDSUB1Q8N9V3 476 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMF1Q92530 271 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 NKD1Q969G9 470 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAJA3Q96EY1 480 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 FRMD6Q96NE9 622 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PTDSS2Q9BVG9 487 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TAPBPLQ9BX59 468 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CDCA4Q9BXL8 241 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CMC2Q9NRP2 79 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CHRNA9Q9UGM1 479 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MED13Q9UHV7 2174 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM72A0PK05 275 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PTHP01270 115 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CXCR1P25024 350 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 DCKP27707 260 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TTKP33981 857 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS5P46782 204 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 DLX5P56178 289 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TUBA3CQ13748 450 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PRAMEF20Q5VT98 475 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2UQ5VVX9 321 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CPOQ8IVL8 374 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PTP4A1Q93096 173 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ISOC1Q96CN7 298 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TMED7Q9Y3B3 224 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ALPK2Q86TB3 2170 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CDRT15L2A8MXV6 281 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 NDUFB2O95178 105 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TSPAN19P0C672 248 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ADORA3P0DMS8 318 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CCL3P10147 92 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PEPDP12955 493 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ICAM2P13598 275 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SSR4P51571 173 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP1A4Q13733 1029 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 OPN5Q6U736 354 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 DTX1Q86Y01 620 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SVOPQ8N4V2 548 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MOSPD2Q8NHP6 518 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ASB15Q8WXK1 588 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 RORBQ92753 470 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MED20Q9H944 212 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 NANSQ9NR45 359 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXL2Q9UKC9 423 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 VDAC3Q9Y277 283 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MED12Q93074 2177 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SUSD5O60279 629 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PCSK6P29122 969 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC6A6P31641 620 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 NXNL2Q5VZ03 156 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PLBD1Q6P4A8 553 aa8.46□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms