RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC16A1P53985 500 aa16.97■□□□□ 0.31
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SH3BP2-220ENST00000511663 AP3D1O14617 1153 aa16.93■□□□□ 0.3
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SH3BP2-220ENST00000511663 WNT11O96014 354 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-220ENST00000511663 PGRP06401 933 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-220ENST00000511663 COPZ1P61923 177 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-220ENST00000511663 C9orf135Q5VTT2 229 aa16.93■□□□□ 0.3
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SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF544Q6NX49 715 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-220ENST00000511663 KLHL24Q6TFL4 600 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-220ENST00000511663 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
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