RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ARAFP10398 606 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 ALKAL2Q6UX46 152 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 APOOLQ6UXV4 268 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 SFXN2Q96NB2 322 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 K7EPK0 472 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 TNFRSF10AO00220 468 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF28P17035 718 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 ESCO2Q56NI9 601 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 PGAP1Q75T13 922 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF765Q7L2R6 523 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa19.94■□□□□ 0.78
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PTPRM-211ENST00000580170 TIMP1P01033 207 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 HTR3AP46098 478 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 CXADRP78310 365 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 C17orf99Q6UX52 265 aa19.94■□□□□ 0.78
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC35F3Q8IY50 421 aa19.94■□□□□ 0.78
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PTPRM-211ENST00000580170 PKDCCQ504Y2 493 aa19.94■□□□□ 0.78
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC39A11Q8N1S5 342 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 OR51Q1Q8NH59 317 aa19.94■□□□□ 0.78
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PTPRM-211ENST00000580170 PGM2L1Q6PCE3 622 aa19.92■□□□□ 0.78
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PTPRM-211ENST00000580170 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 RNF128Q8TEB7 428 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 SORCS2Q96PQ0 1159 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF281Q9Y2X9 895 aa19.92■□□□□ 0.78
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINA2P20848 420 aa19.92■□□□□ 0.78
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