RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
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RPUSD1-201ENST00000007264 S100ZQ8WXG8 99 aa21.9■■□□□ 1.1
RPUSD1-201ENST00000007264 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
RPUSD1-201ENST00000007264 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
RPUSD1-201ENST00000007264 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa21.9■■□□□ 1.1
RPUSD1-201ENST00000007264 MUC3AQ02505 3323 aa21.89■■□□□ 1.1
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC22A31A6NKX4 558 aa21.89■■□□□ 1.1
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RPUSD1-201ENST00000007264 CLDN25C9JDP6 229 aa21.89■■□□□ 1.1
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RPUSD1-201ENST00000007264 LIMS4P0CW20 117 aa21.89■■□□□ 1.1
RPUSD1-201ENST00000007264 FGF5P12034 268 aa21.89■■□□□ 1.1
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RPUSD1-201ENST00000007264 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.1
RPUSD1-201ENST00000007264 ARMC4Q5T2S8 1044 aa21.89■■□□□ 1.1
RPUSD1-201ENST00000007264 C16orf87Q6PH81 154 aa21.89■■□□□ 1.1
RPUSD1-201ENST00000007264 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa21.89■■□□□ 1.1
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RPUSD1-201ENST00000007264 C10orf53Q8N6V4 93 aa21.89■■□□□ 1.1
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RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM43Q9BTV4 400 aa21.89■■□□□ 1.1
RPUSD1-201ENST00000007264 SMOC1Q9H4F8 434 aa21.89■■□□□ 1.1
RPUSD1-201ENST00000007264 STUB1Q9UNE7 303 aa21.89■■□□□ 1.1
RPUSD1-201ENST00000007264 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa21.89■■□□□ 1.1
RPUSD1-201ENST00000007264 VPS13AQ96RL7 3174 aa21.89■■□□□ 1.1
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRN3E7EW58 273 aa21.89■■□□□ 1.09
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RPUSD1-201ENST00000007264 NUDT14O95848 222 aa21.89■■□□□ 1.09
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RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF846Q147U1 533 aa21.89■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF404Q494X3 552 aa21.89■■□□□ 1.09
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RPUSD1-201ENST00000007264 ERVK13-1Q9NX77 482 aa21.87■■□□□ 1.09
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RPUSD1-201ENST00000007264 PGCP20142 388 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 PRPS1P60891 318 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 ZBTB44Q8NCP5 570 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 OR52E2Q8NGJ4 325 aa21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RPUSD1-201ENST00000007264 SPSB2Q99619 263 aa21.86■■□□□ 1.09
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