RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 ADAM19Q9H013 955 aa7.1□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 DSN1Q9H410 356 aa7.1□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 HHATLQ9HCP6 504 aa7.1□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 KLHL1Q9NR64 748 aa7.1□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 SDHAF3Q9NRP4 125 aa7.1□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 MED17Q9NVC6 651 aa7.1□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 MED11Q9P086 117 aa7.1□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 RIMS3Q9UJD0 308 aa7.1□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 AURKCQ9UQB9 309 aa7.1□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 AP4S1Q9Y587 144 aa7.1□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 CROCCQ5TZA2 2017 aa7.1□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.1□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa7.09□□□□□ -1.27
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C16orf62-211ENST00000540101 A0A1W2PRQ8 180 aa7.09□□□□□ -1.27
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C16orf62-211ENST00000540101 GNB5O14775 395 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 EFNA2O43921 213 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 TIPRLO75663 272 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 CBR3O75828 277 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 DIRAS1O95057 198 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 HPNP05981 417 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 CELA3AP09093 270 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 THRBP10828 461 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 RHCEP18577 417 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 SRD5A2P31213 254 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 RYKP34925 604 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 SLC1A3P43003 542 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 YAP1P46937 504 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 MEOX1P50221 254 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 HMGA2P52926 109 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 CDH12P55289 794 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 FOXK1P85037 733 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 CBFBQ13951 182 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 DGCR6Q14129 220 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 OR1Q1Q15612 314 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 ENTPD8Q5MY95 495 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
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C16orf62-211ENST00000540101 ASB18Q6ZVZ8 466 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 GDF7Q7Z4P5 450 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
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C16orf62-211ENST00000540101 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM251Q8N6I4 163 aa7.09□□□□□ -1.27
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C16orf62-211ENST00000540101 ST8SIA1Q92185 356 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF347Q96SE7 839 aa7.09□□□□□ -1.27
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C16orf62-211ENST00000540101 ZNF559Q9BR84 538 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 TTTY12Q9BZ98 90 aa7.09□□□□□ -1.27
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C16orf62-211ENST00000540101 OR2B2Q9GZK3 357 aa7.09□□□□□ -1.27
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C16orf62-211ENST00000540101 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 ACER3Q9NUN7 267 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 MED13Q9UHV7 2174 aa7.09□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 A0A087WZY1 265 aa7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 TRAPPC13A5PLN9 417 aa7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 CLOCKO15516 846 aa7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 CHP2O43745 196 aa7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 FZD7O75084 574 aa7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 NPIPB7O75200 414 aa7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 CYP7B1O75881 506 aa7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 WISP2O76076 250 aa7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 ITGA2P17301 1181 aa7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 PGCP20142 388 aa7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 IL11P20809 199 aa7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 DPP4P27487 766 aa7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 TACR3P29371 465 aa7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 RFC3P40938 356 aa7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 IDH2P48735 452 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 MASP1P48740 699 aa7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 CCR4P51679 360 aa7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 IST1P53990 364 aa7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 GFRA1P56159 465 aa7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
C16orf62-211ENST00000540101 SESN3P58005 492 aa7.08□□□□□ -1.28
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